復旧できなくて残念でしたね。
メッセージの保存容量は無制限ではなく、制限があります。
それ以外にもアドレス帳に掲載できるデータ数などにも制限容量があったりします。
以下のドキュメント(英語になりますが)を参照してください。
Limits - Thunderbird - MozillaZine Knowledge Base
最近では PC のスペックも向上して高性能になり、HDD などのデータメディアも大容量に
なりましたが扱うデータサイズ(容量)は小さい方が負荷も少なく済みますし、クラスタの破
損などの障害も小さくなるでしょう。
Thunderbird に限らずメールクライアントはメッセージを書いたり読んだりする道具であっ
てデータの永久保管庫ではありませんので大量のデータは分割するなり別途バックアップ
するなりして快適な状態を維持・メンテナンスする必要があるでしょう。
またセキュリティ上も更新されない(サポートされない)古いバージョンを使い続けるとリス
クも大きくなるだけです。
以上の理由から早めに最新版にバージョンアップされて大量データも分割・バックアップす
るなどしてより安全・安心・快適な状態に移行されるのをお勧めします。