Thunderbird（バージョン45.8.0と60.5.3）とExchangeの接続設定を行いたいのですが、
アカウントを認証できないときます。
バージョンによる制限等があるものでしょうか？
もしくは設定に違いがあるのでしょうか？

認証方式はOAuth2です
　
Thunderbird（バージョン78.11.0）でExchangeへの接続設定は問題なくできます。

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Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; Win64; x64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/91.0.4472.77 Safari/537.36

出先からなので手短かに。
古いバージョンではMSのOAuth2 には対応していないはずです。

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Mozilla/5.0 (Linux; Android 10; SOV43) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/90.0.4430.210 Mobile Safari/537.36

下記のバグをご覧ください。

Bug 1528136 O365 Two-Factor Authentication Support

Microsoft の認証方式には Thunderbird 78 でようやっと対応したばかりです。
上記バグはすでにクローズされていますが、解決すべき問題はまだ残っているみたいです。

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Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; Win64; x64; rv:89.0) Gecko/20100101 Firefox/89.0