Windows7 64bit
Thunderbird 38.5.1

Imapで複数アカウント設定しています。
@yahoo.co.jpのアカウントのメールを送信すると送信済みトレイに送ったはずのメールが届いていません。
しかし、相手にはしっかり届いています。
また、そのメールアドレスから、そのメールアドレスへ
送ってみたところ、受信はされるのですが
送信済みトレイには残っていないです。

ブラウザからも確認しましたが残っていません。

他の@yahoo.co.jpのアカウントで試してみましたがそれも同症状でした。

原因・改善方法をご存知の方はご協力頂けましたら幸いです。

ええと、まず基本事項として、
「メールを受信者のメールアドレス宛へ送る」ことと、「自分の送信済みトレイにメールを残す」のとは、別個・独立した事柄です。
メールを相手先へ送信するのは、送信用プロトコルであるSMTPのお仕事ですが、自分の手元に控えを残すか残さないかはSMTPは関知せず、個々のメール環境(ここではKZHSさんの手元の）で設定します。

で、IMAP環境ということですので、「アカウント設定」内の「送信控えと特別なフォルダ」にて、
「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」にチェック入っているかどうか＆保存先が「送信済みトレイ」になっているか確認してみてください。
ここにチェックが入っていても保存ができない場合は、セーフモードや新規プロファイル等でどうかも見てみてください。
Thunderbird のセーフモード | Thunderbird ヘルプ
複数のプロファイルを使用する | Thunderbird ヘルプ

yahooのメールアカウントを持っていないので、yahooに依存した問題だったりするとちょっとわからないです。

_________________
Thunderbirdの基本を書いています(ずっと発展途上)　とりかごとなり。
基本の操作(画像あり)：バージョン確認　/ セーフモード / 新規プロファイル作成

　
＊質問・投稿する前に、製品のヘルプ、このフォーラム内を検索・閲覧して該当項目や
　同類・類似事例がないか、確認してみましょう。
　また、広くインターネット上でも同類・類似事例がないか、調べてみましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後は放置せずに、結果や経緯を必ず書くようにし
　ましょう。
＊ここは相互ユーザサポートを通じて、各種情報・事例をユーザ同士でシェアする場で
　もあります。
　
　
まずは、KZHS さんがどのように設定しているかの情報を提示してください。
そうしないと原因らしきものも不明です。

当方では以下の設定と環境で「送信済みトレイ」に送信したメッセージがコピー保存され、
IMAP で同期できています。

・IMAP アカウント：yahoo.co.jp（サーバ名：imap.mail.yahoo.co.jp）
・アカウント設定では、「送信控えと特別なフォルダ」で「メッセージ送信時に自動的に
　コピーを作成する」にチェックを入れて、該当アカウントの「送信済みトレイ」に指定
　している。
・「購読」の設定で「送信済みトレイ」を購読（同期対象）に設定している。
・環境：OS:Windows 7 Professional SP1 + Thunderbird 38.5.1 日本語版


念のため、該当アカウントをフォルダペイン上で選択した状態でメニューの「購読」設定
から、「送信済みトレイ」が購読になっているかを確認してみてください。
ブラウザから該当アカウントのサーバ上に「送信済みメール」フォルダがあるかどうか確
かめてみてください。無ければ、購読設定ができていないと思われます。
　注：Thunderbird の「送信済みトレイ」は、Yahoo サーバ内では「送信済みメール」
　　　になります。

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Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; rv:47.0) Gecko/20100101 Firefox/47.0

皆様、ご返信ありがとうございます。

「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」にチェックは元々入っていなかったのですが
送信メールが二つ残ってしまうため
チェックを外していたのです。

そうするとぴったり1つだけ送信メールが残ってくれてたのですが

履歴を見るとどうも
2015年12月28日までは残っています。
それ以降、2016年からYahooメールの仕様が変わったかもしれません。

例えば、
@outlook.jp
@outlook.com
は未だに「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」のチェックを外していても履歴が残ってくれます。

最後にこの通知メールが迷惑メールに入っていたため気づきませんでした。
返信が遅れてすいません。

　

「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」にチェックを入れていないと、送信メールが
残ってくれるということですが、どこに残っているのですか？
何という名前のフォルダで、誰が作ったフォルダですか？
メッセージフィルタでそのフォルダにコピー保存するような設定はありませんか？

通常、送信済みメッセージは Thunderbird 内には残りません。
どうやって残るようにされているのですか？
その残るように設定されていることで、二つ残ってしまうのではないですか？



履歴って何ですか？
Thunderbird には履歴はありませんが、何を指して履歴と云われているのですか？


先に書いた以下の点はどうでしたか？




【補足】
１．「送信済みトレイ」は Thunderbird が作成する特殊フォルダのひとつで、IMAP アカウント
　　のサーバ側が作成する、あるいは標準で用意されているフォルダではありません。
　　この違い（仕様）を理解して踏まえておいてください。

２．「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」にチェックを入れなくても送信メッセージ
　　がコピー保存されているのは、Thunderbird の機能ではなく、IMAP アカウントのサーバ側の
　　機能ではないでしょうか？
　　つまり、送信メッセージは自動的にサーバ側の特定のフォルダにコピー保存されていると思わ
　　れます。それを IMAP 同期で読み込んでいるために、あたかも Thunderbird の機能と混同さ
　　れていると推察します。
　　
３．今一度、ご利用の IMAP アカウントのサーバ側の機能・仕様とその設定内容を確かめてみるこ
　　とをお勧めします。
　　併せて、Thunderbird 側の購読設定でどのフォルダを購読（同期）するように設定しているか
　　も確かめておくといいでしょう。

　　＃参照：以下は、yahoo.co.jp のメール設定内容です。

_________________
Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; rv:47.0) Gecko/20100101 Firefox/47.0

Yahooに問い合わせてみました。以下がその内容です。

お問い合わせの「メールソフトで送信したメールが保存されない」件について ご案内いたします。 「メールソフトの『送信済みメールを保存する仕組み』」と「SMTP送信」自体に 関連性はございません。 また、SMTPの仕様について、変更は行なっておりません。 そのため、「メールソフトで送信したメールが保存されない事象」は メールソフトそのもので発生しているものであり、弊社で調査することが できません。 また、今までに送信して保存されていないメールが復旧できるかについても わかりかねます。何卒ご了承ください。 ご不明な点がございます場合は、お手数ですがメールソフトの提供元に 直接お問い合わせくださいますようお願い申し上げます。

KZHSさんは、以前に「同じメールが表示される」の質問をしてますよね。
その時、勘違いでヤフーアカウントの「送信控え」のチェックを外してしまったのではないのですか。
「同じメールが表示される」と「2015年12月28日までは残っています。」の時期がどうも近寄ってるようなのですが。

それに、ヤフーのメールシステムとMSのメールシステムを比較しても無意味でしょ。MSのメールシステムは外部からの送信の場合、強制的に送信済み（Webメール）にメールを残す仕様になってます。

_________________
Mozilla/5.0 (Windows NT 6.3; Win64; x64; rv:44.0) Gecko/20100101 Firefox/44.0