IE9に「インポートおよびエクスポート」の機能で別のブラウザーからインポートするを選びブラウザをFirefoxを選択してブックマークの移行を試みましたが、一部のブックマークしかIE9に移行することができません。
全部のブックマークデータをFirefox6からIE9に移行するにはどうしたら良いのでしょうか?

ご利用になった手順は以下でしょうか？
http://support.mozilla.com/ja/kb/Export ... 20Explorer


以下のようなものを使うのも、一つの手法です.
http://homepage3.nifty.com/Tatsu_syo/My ... index.html
http://internet.watch.impress.co.jp/cda ... 20329.html

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[Desktop] Windows 10 pro (64bit) / 16GB RAM

はい。
ただIE9の他のブラウザからIE9にお気に入りデータの取り込みができる機能によるブックマークデータ移行だとうまくいかないのが謎です。

ブックマークのエクスポート～インポートが出来無いと云う事ですが、Internet Explorer8に戻しても同じなのですか？

一応こう云う手も在ります。
サイドバーの各々のブックマークをデスクトップにドラッグします。
コレをInternet ExplorerのFavoritesに移動。
（フォルダ単位では無理です。）
こう云う方法も存在しますので、一度確認を。

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＊Windows 10 21H1 64bit/＊GoogleJapaneseInput：ATOK2017：MS-IME
Firefox 95.0：Beta 96：Developer Edition 96：Nightly 97.0a1：
Thunderbird 91.4.0：Earlybird 96：Daily 97.0a1：SeaMonkey 2.53.10/2.58a1：
Opera 82.0.4227.23：Google Chrome 96.0.4664.93/98.0.4756.0（Official Build）canary：
SRWare Iron 96.0.4900.0：Lunascape 6.15.2：Avant Ultimate 2020 build 3, 3.17.2020

色々見ましたが、FirefoxのブックマークデータをHTMLに変換して、IEに取り込むのが一番良さそうですね。

ありがとうございました。