THUNDERBIRDを起動させたとき、前は新着メールのところ（私は一番下）にスクロールバーがあったのですが、突然一番上にスクロールバーがあるようになりました。毎回新着メールを読むために一番下まで移動させるのが面倒で仕方ありません。よくある質問やインターネットで検索したのですが、よくわからないので
どなたか教えてください。よろしくお願いいたします。

昇順降順が逆転してしまったって言う事でしょうか。

スレッドペイン(メールの一覧表示部)の上部に
[件名] とか [差出人] とか [送信日時] って表示がありますよね。
[送信日時] の所にポインタを持って行くと
「クリックすると送信日時で並べ替えます」というツールチップ表示が出ます。
で、[送信日時] の所をクリックしてみて下さい。
[送信日時] の所にある三角マークが▼になったり▲になったりして
並べ替えの昇順降順が替わります。

質問者さんへ
質問には、あなたの使用している Thunderbird のバージョンおよび OS の種類を明示してください。
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すみません。ＯＳはウインドウズＸＰでThunderbirdはバージョン2.0.0.23と書いてあります。昇降順が変わったのではなくて、一番右端のスクロールバーが、前は受信トレイを開けたときは一番下の新着メールのところにあったのですが今は一番上の古いメールのところにあるので新着メールを見るためにスクロールをわざわざ一番下まで下ろしてこなければいけないので困っています。

すみません。ログインするのを忘れてゲストになってしまいました！

了解です。
ではでは、Thunderbird をセーフモードで起動して現象が再現するか確認してみて下さい。
セーフモードで再現しなければアドオン（拡張機能、テーマなど）が原因となっている可能性があります。
Thunderbird をセーフモードについては以下を参照して下さい。
トラブルシューティング - Mozilla Thunderbird 2.0.0.23 リリースノート