OSX10.5.8
Thunderbird　2.0.0.23
を使っています。

メーリのフィルタリングを以下のように設定しました。
ローカルフォルダ→メッセージフィルタの設定を変更する→自分のアカウントを選択（アカウントは１つです）→件名にxxxが含まれるメールをyyyフォルダへ移動する

フィルタを実行すると規定yyyフォルダへメールが移動されましたが、受信トレイにもメールが残る状態でした。そのため、一度ルールを削除したのですが、その後、何度か同じようにルールを設定してみましたが、フィルタが有効にならないのか、規定のyyy フォルダへも移動されなくなってしまいました。

ヘルプも見てみましたが、やり方は違っていないように思われるのですが、どこが間違っているのか、
ご指摘をお願い致します。

　
フィルタルールはおそらく間違っていないと思われます。
以下の方法で問題を切り分けてみてください。

１．Thunderbird のセーフモードで起動して再現するか確認。
　　再現しないのならアドオンが怪しいです。
　　セーフモードについては以下を参照。

　　「トラブルシューティング - Mozilla Thunderbird 2.0.0.23 リリースノート - Mozilla Japan」
　　http://mozilla.jp/thunderbird/2.0.0.23/releasenotes/#troubleshooting

２．上記１．でも再現するのならば新規プロファイルを作成してそれを適用してみる。
　　新規プロファイルの作成方法は以下を参照。
　　これで再現しなければそれまでのプロファイルに不具合がありそうです。

　　「プロファイルの作成」
　　http://www.mozilla-japan.org/support/thunderbird/profile#new
　

Mac と Win で違いがあるかもしれませんが……。

「共通受信トレイを使用する（"ローカルフォルダ" にメールを保存）」 設定にされてませんでしょうか？

その場合、

で選択する対象アカウントは、その個別のアカウント名ではなく "ローカルフォルダ" を選択して
やらないとうまく動作しなかったような気がします。お試しください。

皆様

ご返信ありがとう御座います。
事情があり、問題が発生したMACでは確認する事ができなくなりました。

ただ、自分の家にあるMACもメーラーOSともに同じバージョンでしたので
確認してみましたが（フィルタを設定していなかったため）
希望した通りの動きが出来ました。

問題が発生しているMACと自宅のMACの違いは、アカウント名、サーバ名くらいです。
その他のオプションは同一にしているので、MAC固有の問題だと思われます。

ちなみに共通受信トレイを利用になっていますが、こちらでは問題が発生しませんでしたため
セーフモードで確認→プロファイル再作成でやってみます。

尚、事情があり、試せるのさ先になってしまいます。
お答え頂いた方、どうも有り難う御座います。

また同様な事象で検索された方、有意義な使い方を出来ず申し訳御座いません。