いつもありがとうございます。
別トピックにもあるとおり、現在Thunderbird 2のテーマの開発を行っております。
そこで質問なのですが、Thunderbird 3に移行するにあたり、対応する為の参考となる
サイトがあればお教えお願いします。
もし無ければ、どういうふうにすれば可能かなど教えて頂ければ幸いです。
よろしくお願い致します。

Thunderbird 3 のアルファ版である Shredder alpha 2 が既に公開されています（日本語版はありませんが）。
これの chrome/classic.jar!/skin/classic/ 以下（つまりテーマの実ファイル）を参考にするのが一番早いかなぁ、と思います。
正式リリースに向けて今後も修正が大量に入ると思いますので追随するのはけっこう大変かと思いますが。

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[Desktop] Windows 10 Pro 22H2 (64bit) / Intel Core i7-2600 / Nvidia GeForce GTX 1650 GDDR6 / 32 GB Memory
[Laptop] Windows 10 Pro 22H2 (64bit) / Intel Core i5-520M vPro / Intel HD Graphics / 8 GB Memory
[Android] Android 13.0 (arm64) / Xperia 5 III (XQ-BQ42)
常用環境: Firefox ベータ版、リリース版 (Win64 x86-64, Android), Thunderbird ベータ版、リリース版 (Win64 x86-64)
テスト環境: Firefox (ESR, Nightly, Win64 x86-64, Android)
Cai/1.0 (Homo sapiens; N; Homo sapiens chemist; male; rv:0.0.4.2+)
-- いつまでたっても nightly