私のはやっかいいです。
症状と環境は以下リンク先と同じなのですが、違うところはThunderBirdPortableをUSBメモリで使用していることです。

プロファイルの問題とまでたどり着いたのですが、、、、初期化の問題について

H:thunderirdportable　-p
と起動してもプロファイル管理のウィンドウが出ません。

メモリ上のThunderbirdpotableのリペア方法はございますか？


# ThunderbirdPortable についての話題なので、「その他」フォーラムへ分割・移動しました。
# 分割・移動に伴い、件名を改訂させて頂きました。また、一部リンク等を加筆しました。
# 以下は本トピ投稿時原文のままの引用です。

Mozilla Thunderbird, Portable Edition をご利用ですか？
USB メモリで正式プロダクトとは少し違うアプリケーションをお使いならば環境も異なると
思うのですが・・・。


先の POCH さんのコメントの中では、
thunderbird.exe -p
とありますが、試されましたか？

もしかすると Thunderbird portable の場合、プロファイルマネージャで起動は無いかもです。
通常の Thunderbird にある profiles.ini が最初からないですし・・・。
(フォルダ、ファイル構成が通常の Thunderbird とは異なります。)
パスを正確に書いて -p の起動オブション付けても通常起動します。
Thunderbird portable もセーフモード起動は出来るんですけど。

E:\ThunderbirdPortable\App\thunderbird\thunderbird.exe -p
というようにフルパスで記述したショートカットで試したところ、プロファイルマネージャが
起動しました。

これも試してみましたが私のはどうもダメです。
通常起動してしまう・・・うーん。
クリーンインストールしてみます。

Windows Xp pro SP2 で Thunderbird portable 2.0.0.9

わかりました、裏でソフトウェアの更新が動いてました。
ソフトウェアの更新ウィンドウを閉じたら
フルバスで書いて -p の起動オブション付けたら
しっかりプロファイルマネージャ起動しました。
バージョンが 2.0.0.9 だったのが災いした様です。
今日はボケばっかり・・・Premier さんごめんなさい。

Premier さん、ひとつだけ確認して欲しいのですが。
以下パスだと ThunderbirdPortable (のプロファイル)じゃなくて
PC 本体の方の Thunderbird (のプロファイル)で起動してませんか?
\ThunderbirdPortable\App\thunderbird\thunderbird.exe
(ドライブ名は各自で違いますが・・・。)

私、Windows の PC 本体の方の方は5つアカウントを設定していて、
ThunderbirdPortable の方は3つアカウントを設定しているのですが
上記パスで起動した場合PC 本体の方の5つアカウントが表示されちゃいます。
App フォルダと同階層の ThunderbirdPortable.exe から起動すると
ThunderbirdPortable に設定した3つアカウントが表示されます。
うちのがおかしいのかなぁ。

私の場合は ThunderbirdPortable にはアカウント設定もしていませんし、データも一切
入れていない状態です。
以下の２つともショートカットを作成し、デスクトップに置いて起動させてます。


USB メモリのアクセスランプが点灯して ThunderbirdPortable から PC 本体側のプロ
ファイルフォルダを開くようです。
パスは以下のとおりです。
E:\ThunderbirdPortable\App\thunderbird\thunderbird.exe -p
プロファイルマネージャを起動する機能ですからこれで正常ではないでしょうか。

ThunderbirdPortable については知見が無いので詳細はわかりませんが、プロファイル
を置く場所が通常の Thunderbird とは違うのでその場所にプロファイルを作成したい場
合は USB メモリドライブ内の該当するフォルダ位置を指定する必要があるのかなと推察
します。
そもそも ThunderbirdPortable では複数のプロファイルを使い分けることができるのか
もわかっていません^^;


私の環境は上記のとおりの初期状態ですのでアカウント設定ウィザードが起動します。
パスは以下のとおりです。
E:\ThunderbirdPortable\ThunderbirdPortable.exe -p

ThunderbirdPortable.exe は ThunderbirdPortable 用の起動プログラムだと思われ
ますのでこれを使用するのが正解だと思います。


# ここまで話が展開してしまいましたが、正式プロダクトとは厳密には異なる仕様やフォルダ
　　構成になっていますので「その他」フォーラムの話題として扱う方がいいように思います。
　　 > qalpha さん

Premier さん、検証・確認ありがとうございました。


ということで、トピを分割しました。


やはり、本体PCの方のプロファイルで立ち上がるのですね。
で、PortableApps.com の Support Forums の方をあたってみました。
以下作者 ( John T. Haller さん)さんがプロファイルマネージャについて回答されてます。
Firefox Portableでの話ですが・・・参考まで。
choose profile (profilemanager??)

PortableApps.com の Support Forums の方を見たついでに類似事例が無いか探してみました。
アップデート後に設定が無くなり、メールが見えなくなった事例がありました。

Profile don't work right after upgrade to 2.0.0.9

最終的にはプロファイルの有る Data フォルダをバックアップして
ThunderbirdPortable を削除(アンインストール)した後に再インストールして
バックアップした Data フォルダの中からメールデータを復旧したようです。
以下投稿に復旧手順が書かれてます。

http://portableapps.com/node/10458#comment-59636

分割、移動お手数をおかけしました。

以下、余談となりますが周辺情報ということでお願いします。


おそらくプロファイルマネージャは起動しているが、PC 本体側のプロファイルを起動している
のではなく、プロファイルフォルダを取得してそれを表示させている動作だと思います。
つまり Thunderbird.exe 自体は正式のものと同じなのでそういう動作をする仕様なのでし
ょう。
ですからプロファイルマネージャ自体は ThunderbirdPortable 内の thunderbird.exe
から起動しているのだと思います。

ThunderbirdPortable プロダクトの作者らしき方が PortableApps.com の Support
Forums で質問に回答しているスレッドを参照すると ThunderbirdPortable 用として動作
するプロファイルマネージャは無いと説明しています。

参照：Thunderbird portable profiles??? | PortableApps.com - Portable software for USB drives

この事から推察するに、ThunderbirdPortable 用のプロファイルフォルダ Data に新たに
プロファイルを作ったり、複数のプロファイルを置いて選択できる仕様ではないと思われます。
ですので何かのトラブルでプロファイルが壊れたり、データが見えなくなった場合の復元方法
は POCH さんが紹介されている方法になるのでしょう。

ぶら下がり質問をされた qalpha さんが出て来られませんが、これで少しは理解がわかりや
すくなり、ご希望の復元する方法も可能になると思います。