Thunderbird2.0.0.9のリリースノートを見てみました。両者間の互換性については別に何の説明も見当たらなかったのですが

* Extension-Friendly Launcher - PortableThunderbird Launcher is included by default. It will alter the paths to any extensions you install to work relatively. Just be sure to close/restart Thunderbird before switching PCs.
* Default Profile - A default profile exists within the thunderbird directory.
* No Email Address Saving - Thunderbird won't automatically save addresses to the address book.
* No Default Mail Client Check - Thunderbird won't check if it is the default mail client and the registry key it updates will be reset on exit.

Upgrading Thunderbird Portable

To upgrade to a newer version of Thunderbird Portable, just install a new copy of Thunderbird Portable right over your old one. All your data will be preserved.

念の為アメリカ(？)の方の
Thunderbird Portable Support Forum
をチェックしましたが、Enigma/gpgを使用している場合はアップデートによって互換性が破壊される危険性があると言うことです。そして、実際に一メンバーから｢破壊された｣と言う報告が入っています。彼は｢公式リリースまで待った方が無難です｣と言っています。

小生は活躍ベースがシリコンヴぇレートフランスですのでこれからそちらのフォーラムへ参加しようと思いますが、メンバー登録は世界中共通ですか。それとも改めてする必要がありますか。