これまでEUDORA6.2のユーザでした。
EUDORAのサポート終了、PCのクラッシュ等が重なり、ThunderBirdに乗り換えました。
EUDORAで2アカウントを作成し、私ともう一人で共用していました。
メインアカウントの移行は問題なく出来たのですが、追加したもう一人のアカウントの移行（設定、アドレス帳、メール）の方法がわかりません。

申し訳ありませんが、どなたか教えてください。

Eudora は知見がありませんが・・・。
Thunderbird をインストール後に同一PC内の他メーラーから別途データインポートする手順としては
Thunderbird を起動して、ツール -> 設定とデータのインポートを選択すると
「設定とデータのインポート」ウィザード画面が立ち上がります。
後はウィザードに従って進めてみてください。
Eudora もこの機能の対象メーラーになっているようです。

EudoraはWindowsユーザーを別にしてメールをユーザのフォルダに置いてあったんでしょうか？
たぶん、Thunderbirdをインストールして実行しているユーザーだけのアカウントしか移行されなかったような気がします。移行元のアカウントの指定さえ出来なかったはずです。

つまり、Aさん、Bさん、それぞれWindowsユーザー毎にThunderbirdのプロファイルを作成してから、対応するWindowsユーザー毎のEudoraのファイルを見て移行する形だと思います。
＃私はシングルユーザーなので試したことはないですが

でも、Eudoraのメールは文字コードと添付ファイルの扱いがThunderbirdには完全に移行できません。ツールを使えば出来ますが苦労します。

参考になるかもしれないということで、
http://kiyo.chips.jp/website/blog/mail_soft/thunderbird/
http://kiyo.chips.jp/website/blog/mail_soft/eudora/
それぞれ、”後ろ”から読んでみてください。Wikiと連携部分を隠してしまったので、無くて困るというところは連絡をいただければ貼り付けます。

＃ ちょうど忙しい時期だったのか、このトピック完全に見落としていました。
＃ 登録メンバーなのでメールが行きますよね