はじめまして。Thunderbird1.5を利用している者です。

迷惑メールが大変多く、フィルタの学習機能について重宝しているところですが
先日フィルタではどうにもならない迷惑メールが届きました。
送信者が、私のメアドと同じメアドであると偽装して送ってきた迷惑メールです。

イメージで言うと、

差出人:×××<○○@○○.ne.jp>(×××は私ではなく別人)
宛先:○○＠○○.ne.jp(差出人のメールアドレスと宛先が同じ)

これに迷惑メールフィルタをかけると、Thunderbirdは
私自身のメールアドレスが迷惑メールの発信元と学習してしまい
以後自分自身が自分の宛先にメールを送信した際、そのメールが
迷惑メールと判断されてしまうと思われます。

自分自身のメールアドレスに偽装したメールに迷惑メールフィルタを
かける方法はないでしょうか。もしくは、今後も同様の迷惑メールが
届いたとしてもこの手のものについては手動で削除するしかないのでしょうか。
ご回答お待ちしております。

Thunderbird の「迷惑メールフィルタ」に関しては、送信者アドレスだけで判断しているわけでは
ないと思いますので大丈夫かと思いますが……（逆に送信者アドレスは見ていない？）
メール本文の内容等を総合的に判断して、迷惑メールかどうかを判断しているはずです。
もし間違えて自分から自分に送信したメールが間違えて迷惑メールフィルタに引っかかったと
しても、迷惑メールのチェックを外してやればそのことを学習して、だんだんと精度が増すと
思いますよ。

メッセージフィルタで、
差出人が自分のメールアドレス、かつ、Thunderbird 以外から送信したメールは、
迷惑メールフォルダへ移動でどうでしょうか。「User-Agent」は、「カスタムヘッダ」で追加します。

すべての条件に一致
差出人 に次を含む 自分のメールアドレス
User-Agent に次を含まない　Thunderbird

参考：もじら組フォーラム　自分のアドレスを送信者にした迷惑メールについて
http://forum.mozilla.gr.jp/?mode=al2&na ... &&KLOG=240

Windows XP SP2, Thunderbird 2.0.0.5 日本語版

迷惑メールフィルタでの対処に少々不安があったので
Kokkoさんの仰るとおりに設定をしてテストしたら
自分のメールアドレスにフィルタをかけながら
自分自身のメールを受信することができました。
ありがとうございました。