バージョン1.0.7で大量のメッセージ（1.5GB程度）を最適化中に時間がかかるためThunderbirdを終了してしまいました。次に立ち上げたところ全く新規に立ち上がりアカウント設定を求められました。
つまり今までの送受信メールが全てなくなってしまいました。
メール保存先は確認しているのでそのデータを手順に従いINBOXに移動しましたが、全く読めなく
なってしましました。
このデータを再生する方法はありませんか。

復旧手順、状況がイマイチ判らないのですが・・・。
索引ファイルとメールデータファイルの不整合によるものかも知れません。
Inbox.msf を再構築させてみてはどうでしょうか?
Thunderbird を停止した状態で　Inbox.msf を一度削除してから Thunderbird を再起動で
受信ボックスを表示させるとどうでしょうか?

# 1.0.7 はサポート終わってますので、1.5系もしくは2.0系へのアップデートされるのがよろしいかと。