[quote="KZHS"]履歴を見るとどうも
2015年12月28日までは残っています。
それ以降、2016年からYahooメールの仕様が変わったかもしれません。

例えば、
@outlook.jp
@outlook.com
は未だに「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」のチェックを外していても履歴が残ってくれます。[/quote]
KZHSさんは、以前に「[url=http://forums.mozillazine.jp//viewtopic.php?f=3&t=15838]同じメールが表示される[/url]」の質問をしてますよね。
その時、勘違いでヤフーアカウントの「送信控え」のチェックを外してしまったのではないのですか。
「同じメールが表示される」と「2015年12月28日までは残っています。」の時期がどうも近寄ってるようなのですが。

それに、ヤフーのメールシステムとMSのメールシステムを比較しても無意味でしょ。MSのメールシステムは外部からの送信の場合、強制的に送信済み（Webメール）にメールを残す仕様になってます。

Yahooに問い合わせてみました。以下がその内容です。

お問い合わせの「メールソフトで送信したメールが保存されない」件について ご案内いたします。 「メールソフトの『送信済みメールを保存する仕組み』」と「SMTP送信」自体に 関連性はございません。 また、SMTPの仕様について、変更は行なっておりません。 そのため、「メールソフトで送信したメールが保存されない事象」は メールソフトそのもので発生しているものであり、弊社で調査することが できません。 また、今までに送信して保存されていないメールが復旧できるかについても わかりかねます。何卒ご了承ください。 ご不明な点がございます場合は、お手数ですがメールソフトの提供元に 直接お問い合わせくださいますようお願い申し上げます。

　
[quote="KZHS"]「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」にチェックは元々入っていなかったのですが
送信メールが二つ残ってしまうため
チェックを外していたのです。

そうするとぴったり1つだけ送信メールが残ってくれてたのですが[/quote]
「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」にチェックを入れていないと、送信メールが
残ってくれるということですが、どこに残っているのですか？
何という名前のフォルダで、誰が作ったフォルダですか？
メッセージフィルタでそのフォルダにコピー保存するような設定はありませんか？

通常、送信済みメッセージは Thunderbird 内には残りません。
どうやって残るようにされているのですか？
その残るように設定されていることで、二つ残ってしまうのではないですか？


[quote="KZHS"]履歴を見るとどうも
2015年12月28日までは残っています。
それ以降、2016年からYahooメールの仕様が変わったかもしれません。

例えば、
@outlook.jp
@outlook.com
は未だに「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」のチェックを外していても履歴が残ってくれます。[/quote]
履歴って何ですか？
Thunderbird には履歴はありませんが、何を指して履歴と云われているのですか？


先に書いた以下の点はどうでしたか？
[quote="kiki"]まずは、KZHS さんがどのように設定しているかの情報を提示してください。[/quote]
[quote="kiki"]念のため、該当アカウントをフォルダペイン上で選択した状態でメニューの「購読」設定
から、「送信済みトレイ」が購読になっているかを確認してみてください。
ブラウザから該当アカウントのサーバ上に「送信済みメール」フォルダがあるかどうか確
かめてみてください。無ければ、購読設定ができていないと思われます。
　注：Thunderbird の「送信済みトレイ」は、Yahoo サーバ内では「送信済みメール」
　　　になります。[/quote]


【補足】
１．「送信済みトレイ」は Thunderbird が作成する特殊フォルダのひとつで、IMAP アカウント
　　のサーバ側が作成する、あるいは標準で用意されているフォルダではありません。
　　この違い（仕様）を理解して踏まえておいてください。

２．「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」にチェックを入れなくても送信メッセージ
　　がコピー保存されているのは、Thunderbird の機能ではなく、IMAP アカウントのサーバ側の
　　機能ではないでしょうか？
　　つまり、送信メッセージは自動的にサーバ側の特定のフォルダにコピー保存されていると思わ
　　れます。それを IMAP 同期で読み込んでいるために、あたかも Thunderbird の機能と混同さ
　　れていると推察します。
　　
３．今一度、ご利用の IMAP アカウントのサーバ側の機能・仕様とその設定内容を確かめてみるこ
　　とをお勧めします。
　　併せて、Thunderbird 側の購読設定でどのフォルダを購読（同期）するように設定しているか
　　も確かめておくといいでしょう。

　　＃参照：以下は、yahoo.co.jp のメール設定内容です。
[attachment=0]Yahoo-メールの設定-全般-メール一覧.png[/attachment]

皆様、ご返信ありがとうございます。

「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」にチェックは元々入っていなかったのですが
送信メールが二つ残ってしまうため
チェックを外していたのです。

そうするとぴったり1つだけ送信メールが残ってくれてたのですが

履歴を見るとどうも
2015年12月28日までは残っています。
それ以降、2016年からYahooメールの仕様が変わったかもしれません。

例えば、
@outlook.jp
@outlook.com
は未だに「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」のチェックを外していても履歴が残ってくれます。

最後にこの通知メールが迷惑メールに入っていたため気づきませんでした。
返信が遅れてすいません。

　
[color=#006600]＊質問・投稿する前に、製品のヘルプ、このフォーラム内を検索・閲覧して該当項目や
　同類・類似事例がないか、確認してみましょう。
　また、広くインターネット上でも同類・類似事例がないか、調べてみましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後は放置せずに、結果や経緯を必ず書くようにし
　ましょう。
＊ここは相互ユーザサポートを通じて、各種情報・事例をユーザ同士でシェアする場で
　もあります。[/color]
　
　
まずは、KZHS さんがどのように設定しているかの情報を提示してください。
そうしないと原因らしきものも不明です。

当方では以下の設定と環境で「送信済みトレイ」に送信したメッセージがコピー保存され、
IMAP で同期できています。

・IMAP アカウント：yahoo.co.jp（サーバ名：imap.mail.yahoo.co.jp）
・アカウント設定では、「送信控えと特別なフォルダ」で「メッセージ送信時に自動的に
　コピーを作成する」にチェックを入れて、該当アカウントの「送信済みトレイ」に指定
　している。
・「購読」の設定で「送信済みトレイ」を購読（同期対象）に設定している。
・環境：OS:Windows 7 Professional SP1 + Thunderbird 38.5.1 日本語版


念のため、該当アカウントをフォルダペイン上で選択した状態でメニューの「購読」設定
から、「送信済みトレイ」が購読になっているかを確認してみてください。
ブラウザから該当アカウントのサーバ上に「送信済みメール」フォルダがあるかどうか確
かめてみてください。無ければ、購読設定ができていないと思われます。
　注：Thunderbird の「送信済みトレイ」は、Yahoo サーバ内では「送信済みメール」
　　　になります。

ええと、まず基本事項として、
「メールを受信者のメールアドレス宛へ送る」ことと、「自分の送信済みトレイにメールを残す」のとは、別個・独立した事柄です。
メールを相手先へ送信するのは、送信用プロトコルである[url=https://ja.wikipedia.org/wiki/Simple_Mail_Transfer_Protocol]SMTP[/url]のお仕事ですが、自分の手元に控えを残すか残さないかはSMTPは関知せず、個々のメール環境(ここではKZHSさんの手元の）で設定します。

で、IMAP環境ということですので、「アカウント設定」内の「送信控えと特別なフォルダ」にて、
「メッセージ送信時に自動的にコピーを作成する」にチェック入っているかどうか＆保存先が「送信済みトレイ」になっているか確認してみてください。[attachment=0]sent.png[/attachment]
ここにチェックが入っていても保存ができない場合は、セーフモードや新規プロファイル等でどうかも見てみてください。
[url=https://support.mozilla.org/ja/kb/safe-mode]Thunderbird のセーフモード | Thunderbird ヘルプ[/url]
[url=https://support.mozilla.org/ja/kb/using-multiple-profiles]複数のプロファイルを使用する | Thunderbird ヘルプ[/url]

yahooのメールアカウントを持っていないので、yahooに依存した問題だったりするとちょっとわからないです。

Windows7 64bit
Thunderbird 38.5.1

Imapで複数アカウント設定しています。
@yahoo.co.jpのアカウントのメールを送信すると送信済みトレイに送ったはずのメールが届いていません。
しかし、相手にはしっかり届いています。
また、そのメールアドレスから、そのメールアドレスへ
送ってみたところ、受信はされるのですが
送信済みトレイには残っていないです。

ブラウザからも確認しましたが残っていません。

他の@yahoo.co.jpのアカウントで試してみましたがそれも同症状でした。

原因・改善方法をご存知の方はご協力頂けましたら幸いです。