バックアップやプロファイルのインポート等についてご説明いただき感謝します！
この記事はブックマークしてことあるごとに確認しようと思います。

サンダーバードは自由度が高く機能が多彩、
そのうえとても使い勝手がよいと常々思っています。
バックアップもアーカイブを使えば簡単なのにこの10年以上利用していませんでした。
だんだん面倒になってくるのですよね…。
今回のことは私の無精が招いたこと。
無精も過ぎるとこのような現象が起きることがあると
ひとつの知見になれば幸いです。
これからもサンダーバードを使い続けていきたいと思います！

[quote="watassh"]ご指示通りの作業を行って14日前までのデータは復旧しました。[/quote]
デフォルト設定でしたか。
14日分とはいえ、メール復旧できてよかったですね。

[quote="watassh"]これからは…
・たまにはバックアップをとる
・メッセージをため込まない
…ようにしようと思います。[/quote]
はい、大事なことだと思います。
受信トレイに溜め込まないためには、（利用された痕跡がありますが）アーカイブ機能を利用するとよいでしょう。
[url=https://support.mozilla.org/ja/kb/archived-messages]メッセージの保管 | Thunderbird ヘルプ[/url]
Thunderbird は検索機能が優秀なので、メールをアーカイブ下のサブフォルダーに移動しても問題ありません。
必要なら「検索フォルダー」を使って関連するメールを1つの仮想フォルダーにまとめることもできます。

バックアップに関してはプロファイルフォルダーのコピーを作るだけなのですが、正しく行うためにはThunderbirdを終了する必要があるため面倒に感じることもあるでしょう。
そういう場合は、拡張機能の「[url=https://addons.thunderbird.net/ja/thunderbird/addon/importexporttools-ng/]ImportExportTools NG[/url]」をおすすめします。

この拡張機能の主目的は、Thunderbirdにフォルダーやメッセージのインポート／エクスポート機能を追加することで、Thunderbirdのデータ引越時の手順としてこれをインストールすることを前提として説明しているブログやキュレーションサイトの記事をよく見かけます。
それに関しては私は拡張機能は不要という意見なのですが、プロファイルのインポート／エクスポート／バックアップ機能が追加されており、これが意外と便利です。
Thunderbirdを起動中に指定したバックアップ先にバックアップが行え、指定間隔や終了時にバックアップのダイアログを出すようにもできます。

お返事有難うございます。

サーバーの設定は標準のまま以下のとおりでした。
☑ ダウンロード後もサーバーにメッセージを残す
☑ ダウンロードしてから［　14 ］日以上経過したメッセージは削除する
☑ ダウンロードしたメッセージを削除したらサーバーからも削除する

ご指示通りの作業を行って14日前までのデータは復旧しました。
ありがとうございます！

これ以上の受信データは戻らないと諦めます。
今回受信フォルダーのメッセージを全て失って焦りましたが
送信メッセージが残っているのが救いだと気づきました。
重要なメールにはだいたい返信しているはずなので
過去の受信メッセージもそれに付随していることが多いからです。

これまで20年もサンダーバードを使わせていただき
トラブルらしいものは一度もなく安心しきっていました。
簡単なメンテナンスすら怠った結果がこれですから、自業自得です。
これからは…
・たまにはバックアップをとる
・メッセージをため込まない
…ようにしようと思います。
（ハードディスクやパソコン本体の信頼性があがったと思いこみ
この10年くらいパソコン自体のバックアップもずっとしていないことに気付きました。
昔は頻繁にバックアップしていたのですが…。）
EarlgreyTea様にはこれまで親身になってご教授いただき心から感謝します。
本当に有難うございました！

[quote="watassh"]やはりメッセージはごっそり消えてしまったのだと思われます。[/quote]
9年前以外のバックアップが無いのであれば、ローカルには残っていないということになりそうです。

では、サーバーはどうでしょうか。
おそらく、問題のメールアドレスのPOPアカウントでは、サーバー設定にて

[list]☑ ダウンロード後もサーバーにメッセージを残す[/list]

の設定がされているのではないかと思います。
もしそうであれば、ダウンロード後も（ある程度は）メールが残っているはずです。

標準のままだとその下の2項目も設定されていて

[list]☑ ダウンロード後もサーバーにメッセージを残す[list]
☑ ダウンロードしてから［　14 ］日以上経過したメッセージは削除する
☑ ダウンロードしたメッセージを削除したらサーバーからも削除する
[/list][/list]

これだと14日経過で削除してしまいますが、チェックを外していたり日数を大きく変更していたら、割と残っていることが期待できます。

サーバーにメールが残っているなら、それを再ダウンロードするだけです。
ThunderbirdのPOPアカウントでは、サーバーからダウンロード済みのメールを「popstate.dat」というファイルに記録することで、未ダウンロードのメールのみダウンロードする管理を行っています。
したがいまして、このファイルを削除するとサーバー上にあるメールを最初から全てダウンロードすることになります。

watassh さんの環境では「共通受信トレイ」を使用されているので、

プロファイルフォルダー
　Mail
　　Local Folders
　　　Inbox
　　　Inbox.msf
　　　...
　　問題のメールアドレスのサーバー名
　　　popstate.dat
　　　...
　　今は使っていないメール(1)のサーバー名
　　　...
　　今は使っていないメール(2)のサーバー名
　　　...
　　今は使っていないメール(3)のサーバー名
　　　...

という具合になっているはずです。
アカウントの下にある「popstate.dat」を削除し、それから Thunderbirdを起動してみてください。

【追記】
削除する前に popstate.dat のサイズも気にしてみましょう。

お返事有難うございます。
その他のアカウントの受信トレイも全部確認してみましたが見当たりませんでした。
また、あってほしいメールをグローバル検索してみましたが見つかりませんでした。
やはりメッセージはごっそり消えてしまったのだと思われます。

受信トレイは共通受信トレイ (ローカルフォルダー)の運用だったということですね。
その他のアカウントの受信トレイも全部確認してみてください。
また、あってほしいメールをグローバル検索で探してみてください。

Thunderbirdを終了させた状態で、問題の「Inbox」ファイルを任意の名前にリネームし。
「Inbox.msf」ファイルを削除してThunderbirdを起動させました。
その結果
受信トレイは自動で再生成されて空の受信トレイができました。
画面上でリネームした名前のフォルダーとして見え、その中にメールのメッセージリスト表示されましたが
それは事故後に受信されたいくつかのメッセージで消えたものは表示されていませんでした。
どうぞ宜しくお願い致します。

お世話になります。
ご質問にお答えします。

まず「ローカルフォルダー」の運用状況となります。

V ローカルフォルダー
　V 受信トレイ
　　下書き
　V 送信済みトレイ
　> アーカイブ
　　迷惑メール
　　ごみ箱
　　送信トレイ
　> 下書き（昔使っていた下書きフォルダです）
　> 削除済みアイテム

次に
POPアカウントのアカウント設定＞サーバー設定＞「メッセージの保存」の右側の「詳細」
には…
○別のアカウントの受信トレイ　「ローカルフォルダ」
☑新着メールの取得時にこのサーバーも同時に受信
…となっています。

アカウント設定には…

V ○○○＠○○○（問題のメールアドレス）
　・・・
V 今は使っていないメール（1）
　・・・
V 今は使っていないメール（2）
　・・・
V 今は使っていないメール（3）
　・・・
V ローカルフォルダ
　・・・
　□送信（SMTP）サーバー

…と書かれています。

[quote="watassh"]お返事などは明日PCに向かってさせていただきます。[/quote]
はい、よろしくお願いします。
なお、私は逆に平日日中の仕事中はこちらを見れませんので、すぐに応答はできません。
休憩時間にスマホで見てコメントする可能性はあります。

お返事感謝します。
また私の勘違いを正確にご理解いただき有難うございます。
トラブルを起こしたのは会社のPCなのですが今日はお休みなのです。
お返事などは明日PCに向かってさせていただきます。
日曜日だというのにご対応いただき本当に有難うございました。

watassh さん

[url=https://forums.mozillazine.jp/viewtopic.php?f=3&p=78197#p78197]17:31の投稿[/url]では、ローカルフォルダーにInboxファイルを入れて試すことを考えていましたが、ひとまずこうしてみましょう。

Thunderbirdを終了させた状態で、問題の「Inbox」ファイルを任意の名前にリネームしてください。
「受信トレイのバックアップ」でも何でもいいです。
それに加えて、「Inbox.msf」ファイルを削除しておきます。
その状態でThunderbirdを起動してください。

受信トレイは自動で再生成されて空の受信トレイができます。
元の「Inbox」が壊れていなければ、画面上でリネームした名前のフォルダーとして見えて、その中にメールがメッセージリスト表示されるはずです。

[quote="watassh"]いつのまにかinboxファイルとTrashファイルの容量が
それぞれたった13MB、3.6MBに激減していました。[/quote]
このInboxファイルの状況を調べる必要があるわけですが、とりあえず「ローカルフォルダー」アカウントに入れて「受信トレイ」としてメールを見ることができるかやってみましょう。

と思ったのですが、
[quote="watassh"]Local　Folders　の容量は5.5GBありますが
そのうち容量の大きいのは過去のメールArchives.sbdが2.3GB、
Sentファイルが2.4GBとなっています。[/quote]これが気になりました。

これって「ローカルフォルダー」アカウントの下に
－－－－－－－－－－
V ローカルフォルダー
　　送信済みトレイ
　> アーカイブ
　　ごみ箱
　　送信トレイ
－－－－－－－－－－
という具合になっているということでしょうか。
そしてもしかして「受信トレイ」もあったりしますか？
だとすると、POPアカウントの受信をいわゆる「共通受信トレイ (ローカルフォルダー)」で行う運用をしていたということになります。
※POPアカウントのアカウント設定＞サーバー設定＞「メッセージの保存」の右側の「詳細」

無用な事故を避けたいので、「ローカルフォルダー」の運用状況をご確認お願いします。
できればプロファイルにいくつのアカウントを設定されているかも合わせて教えてください。

[quote="watassh"]ご指示通りProfilesフォルダーのバックアップをとりました。[/quote]
Profilesフォルダー丸ごとのバックアップでしょうか？
それならそれで構わないのですが、私の手順はProfilesの中の現在使用しているプロファイルフォルダー1つをバックアップするものだったはずです。
なるべく無用な齟齬はなくしていきましょう。

[quote="watassh"]また、Profilesフォルダーの容量を確認してみて何だか少ない気がしたので[/quote]
バックアップ対象のフォルダーのサイズが10GB超え[list][quote="watassh"]不思議に思ってファイルを確認したらInboxファイルの容量はまだ3.5GBあります。
さらに不思議なのは空にしたはずのゴミ箱Trashファイルの容量がまだ8.5GBもあることです。[/quote][/list]するものではなかった、という意味ですね。

[quote="watassh"]いつのまにかinboxファイルとTrashファイルの容量が
それぞれたった13MB、3.6MBに激減していました。[/quote][quote="watassh"]きのう確認した3.5GBのInboxファイルと8.5GBのTrashファイルは
9年前にバックアップしたProfilesフォルダのものでした。
Inboxという名前でPCのなかを検索して最初に出てきたので
それだと思い込んでしまったのです。[/quote]
なるほど。
「Inbox」というファイル名は知っていてもメッセージの保存先フォルダーについて理解していないと
「Inbox」でやみくもに検索するような行動になってしまうのですね。
バックアップの件で少し気にはなっていました。
結局、Trashファイルはごみ箱を空にする操作でいったんはサイズ０で作り直されており、その後いくつか削除メールが入ることで3.6MBになったと考えれば何も不思議はなかったということですね。

[quote="watassh"]これは復元の望みはなくなったという事でしょうか…？[/quote]
粛々と今できることを順にやっていきましょう。
バックアップができたようですので、やっとこれから調査を開始できるという段階です。
いったん、投稿を区切ります。

申し訳ありません、私の勘違いがあったので報告します。
きのう確認した3.5GBのInboxファイルと8.5GBのTrashファイルは
9年前にバックアップしたProfilesフォルダのものでした。
Inboxという名前でPCのなかを検索して最初に出てきたので
それだと思い込んでしまったのです。
よくよく場所を確認したらわかりました。
いつのまにかファイルの容量が激減するわけはありませんよね。
惑わすようなことになってしまい申し訳ありませんでした。
ちなみにTBはたしか2003年くらいから使い始めたような記憶があります。
過去の受信データのうち2015年までのものはバックアップが存在しました。
とはいえ本当に欲しいのはその後のほうなのですが・・・
愚痴っぽくなりました、スミマセン。

早速お返事いただき有難うございました。
またきのうは外出中だというのにご対応いただき感謝します！

ご指示通りProfilesフォルダーのバックアップをとりました。
また、Profilesフォルダーの容量を確認してみて何だか少ない気がしたので
展開して確認してみたら
いつのまにかinboxファイルとTrashファイルの容量が
それぞれたった13MB、3.6MBに激減していました。
Trashファイルの容量が小さくなるのはいいのですが
Inboxが減ってしまったというのはショックです。
Local　Folders　の容量は5.5GBありますが
そのうち容量の大きいのは過去のメールArchives.sbdが2.3GB、
Sentファイルが2.4GBとなっています。
これは復元の望みはなくなったという事でしょうか…？
どうぞ宜しくお願い致します。