同じトラブルが発生しましたが、解決方法がありました。
テンプレート作成時に、画面にある「Reply-To」の選択を空欄にしてテンプレート化すると
自動返信の最上段にソース？が書き込まれないようです。

大変時間が空いてしまい申し訳ありません。

3)新しいプロファイルを作ってそこで確認してもらった方がいいかもしれません。
→ Thunderbirdを一度削除、再インストールしプロファイルも再作成。すべてやり直したところ、症状が改善しました。
EarlgreyTea様ほか、アドバイスをくださった皆様、本当にありがとうございました。
あとはまた同じ症状が出ないよう祈るばかりです。

[quote="mujina"]→ これも試してみました。自動で送信の場合は問題の差出人情報がメール本文に入ってしまい、手動の場合は送信できませんでした。[/quote]
これは、自分宛のテストメールに対し
[list]
[*]メッセージフィルターを受信時に動作させた場合は、差出人情報がメール本文に入って返信メールが送信された
[*]メッセージフィルターを手動で実行した場合は、返信メールが送信できなかった[/list]ということでよろしいでしょうか。
ところで、「差出人情報」とは当初の現象の「ソースのようなもの」のことでしょうか。（差出人情報以外のヘッダーも含まれていたはずなので確認です）

[quote="mujina"]→ 〇〇のアドレス帳にあるアドレスが送信元になっているメールに対して返信。というフィルタを10個適用しています。（アドレス帳をグループ分けしているため）[/quote]
条件が（「差出人」「がアドレス帳にある」：アドレス帳を指定 ）な自動返信ルールが10個ですね。
それ以外に振り分けなどのルールはありませんか。

[quote="mujina"]→ 現在、出勤する機会が減っているため、この状況が落ち着いてから試してみたいと思います。[/quote]
了解です。

[quote="mujina"]→ その可能性があるかも？と思い、自分が送ったテストメール以外はフォルダから除いてテストしましたので、他の方には送信していないと思います。[/quote]
安心しました。
しかし、そうすると手動実行では送信できないのが謎です。

それについては不明ですが、テストメールで自動返信の本文の頭に意図しないものが入りこむ現象の再現が可能になった、という点については一歩前進です。

そのテストメールが電子署名されたものではない普通のメールなのであれば、ほぼ同じ条件（同じメッセージフィルターとテンプレート）の確認をご自宅で行うことも可能かと思います。
そこで再現したら最小環境での原因調査が可能ということですし、再現しなければ何らかの環境依存の問題と切り分けができるかと思います。

1)そこで、自分宛にテストメール送信し、それを受信した際に自動返信のメッセージフィルターが動作するようにして再現確認をお願いします。
→ これも試してみました。自動で送信の場合は問題の差出人情報がメール本文に入ってしまい、手動の場合は送信できませんでした。

2)それより、メッセージフィルターのルールが壊れている可能性もあります。ルールはいくつくらい設定してるんでしょう。
→ 〇〇のアドレス帳にあるアドレスが送信元になっているメールに対して返信。というフィルタを10個適用しています。（アドレス帳をグループ分けしているため）

3)新しいプロファイルを作ってそこで確認してもらった方がいいかもしれません。
→ 現在、出勤する機会が減っているため、この状況が落ち着いてから試してみたいと思います。（作業中に不具合が出てしまうと通常業務に支障が出てしまうため、だいぶ先になると思います。申し訳ありません。）

4)受信トレイにメッセージフィルターの自動返信ルールの対象メールはいったい何通あったのでしょう。
それがメッセージフィルターを1通に対してではなく、フォルダーに対して手動実行してしまったら、対象のメールすべてに対して連続で自動転送の処理を行うことになります。
→ その可能性があるかも？と思い、自分が送ったテストメール以外はフォルダから除いてテストしましたので、他の方には送信していないと思います。

自分の投稿見直してみて気づきました。

[quote="EarlgreyTea"][color=gray][i]普段は受信時にしか動作しないですが、受信トレイにメール入れっぱなしで手動実行したら、
複数のメールを再度返信しまくる、なんてことになりかねないんですね。[/i][/color][/quote]
これが実際に起こっていたんじゃないでしょうか。
受信トレイにメッセージフィルターの自動返信ルールの対象メールはいったい何通あったのでしょう。
それがメッセージフィルターを1通に対してではなく、フォルダーに対して手動実行してしまったら、対象のメールすべてに対して連続で自動転送の処理を行うことになります。
その結果が「フィルター 自動返信テスト用 の評価に失敗しました。フィルターの評価を続けますか？」ということだったのではないでしょうか。

メニュー＞メッセージフィルター＞メッセージにフィルター適用
のイメージで考えていたので、ちょっと配慮が足りなかったみたいです。
ところで、実際のメールに自動返信を再度かけてしまったのだとしたら、相手への迷惑になってないでしょうか。

[quote="mujina"]→ https://imgur.com/rvED0xd.png
（直リンクというのはこれであっていますでしょうか？）[/quote]
それでもリダイレクトしてくれるので問題ないです。
ちなみにリダイレクト後のURLは https://i.imgur.com/rvED0xd.png になります。

[img]https://i.imgur.com/rvED0xd.png[/img]
[code]X-Yahoo-Newman-Property:
X-Yahoo-Newman-Id:
X-YMail-OSG:[/code]というのがYahoo!メール固有のヘッダー、
[code]DKIM-Signature:
DomainKey-Signature:[/code]が電子署名に関するヘッダーですね。

[quote="mujina"]→ フィルターの設定の画面で、
・「新着メール受信時」のチェックをはずし、
・「手動で実行する」にチェックを入れたのち、
・ メッセージフィルターの画面に戻り、「今すぐ実行」をクリック。
このやり方で試してみたのですが、機能しないのかメールが送信できません。[/quote]
試してみましたが、そのやりかたでもできましたし、
「新着メール受信時」「手動で実行する」どちらもチェック入れたまま、
返信させたいメール開いておいて、メニュー＞メッセージフィルター＞メッセージにフィルター適用 でも自動返信が動作しました。

[list][color=gray][i]余談ですが、自動返信はあまり使ってなかったので今更ながらに気づきましたが、
普段は受信時にしか動作しないですが、受信トレイにメール入れっぱなしで手動実行したら、
複数のメールを再度返信しまくる、なんてことになりかねないんですね。
処理済みのメールをアーカイブするとかしないとそういうトラブルがありそうです。[/i][/color][/list]

さて、

[quote="mujina"]試行錯誤しているうちに、「フィルター 自動返信テスト用 の評価に失敗しました。フィルターの評価を続けますか？」というメッセージが出るようになりました。[/quote]
それは、[code]continueFilterExecution = フィルター %S の評価に失敗しました。フィルターの評価を続けますか？[/code]というエラーメッセージですね。原因はわかりませんが、メッセージフィルターの処理でエラーが発生しているようです。
メッセージフィルター画面のフィルターログを見れば何かわかるかもしれませんが、あまり期待はできないかもしれません。

それより、メッセージフィルターのルールが壊れている可能性もあります。
ルールはいくつくらい設定してるんでしょう。

前の投稿で書きました、自分宛のテストメールにメッセージフィルターを適用する確認を、新しいプロファイルを作ってそこで確認してもらった方がいいかもしれません。

出先からなので夜に帰ってから確認してみますが取り急ぎ

もしかすると返信済みフラグが付いたメールは処理されないのかも。
そこで、自分宛にテストメール送信し、それを受信した際に自動返信のメッセージフィルターが動作するようにして再現確認をお願いします。
フィルターの条件だけ変えて動作は同じ(同じテンプレート)でお願いします。
どうやっても再現できないなら、実際のメールの方が発生条件になっていると判断できます。

メールのソースはチラッと見ましたが、Yahooから送信され、電子署名されたもののようですね。

追記です。

先の2)同じメールに手動でメッセージフィルター適用して問題発生することを確認してください。についてですが、
試行錯誤しているうちに、「フィルター 自動返信テスト用 の評価に失敗しました。フィルターの評価を続けますか？」というメッセージが出るようになりました。
（送信できないことには変わりありません）

1)返信元メールは Thunderbird の受信トレイに入ってると思いますので、それのソースを調べてください。
→ https://imgur.com/rvED0xd.png
（直リンクというのはこれであっていますでしょうか？）

2)同じメールに手動でメッセージフィルター適用して問題発生することを確認してください。
→ フィルターの設定の画面で、
・「新着メール受信時」のチェックをはずし、
・「手動で実行する」にチェックを入れたのち、
・ メッセージフィルターの画面に戻り、「今すぐ実行」をクリック。
このやり方で試してみたのですが、機能しないのかメールが送信できません。
そもそもやり方が間違っているのでしょうか？

出先から失礼します。

mos さん、情報ありがとうございます。
たしかにスペース入ってませんでしたね。


mujina さん
送信元は関係ありません。
返信元メールは Thunderbird の受信トレイに入ってると思いますので、それのソースを調べてください。

手動で返信した場合は問題ないそうですが、同じメールに手動でメッセージフィルター適用して問題発生することを確認してください。
問題の原因が返信元メールにあるのか、メッセージフィルターによる自動返信にあるのかを切り分けるための確認になります。

[quote="EarlgreyTea"][code]>From - Tue Apr 14 15:01:58 2020[/code]に注目してください。

頭にメール引用の ">" が付いています。
これならメールの開始行ではなく、メール本文の一部として表示されるでしょう。
でも引用なら、Thunderbirdでは普通は色付きの縦棒表示になるはず…
[/quote]
これは、Thunderbirdの特徴的な動作かもしれません。
mboxは、本文中に「From 」で始まる行があると、次のメールと区別ができません。
そのためThunderbirdは、受信したメールの本文に「From 」で始まる行があると「>From 」に置き換えます。
引用処理とは異なり、「>」と「From 」の間にスペースは挿入されません。

なお、Thunderbirdから送信する場合に「From 」で始まる行がある場合は、「 From 」に置き換えて送信されます。
また、バージョンによっては動作が異なるかもしれません。

Need to unescape "From " lines in the msg body before displaying them to the UI.
https://bugzilla.mozilla.org/show_bug.cgi?id=121947

1)返信元メールのソースを調べてください。
→ 送信元がyahooメールなので、「詳細ヘッダー」というものしか表示できなさそうです。
プロバイダメールの方で試してみます。少々お時間頂戴します。

2)自動返信で使ってるテンプレートも怪しい気がします。
→ 初めて自動返信を使ってみた2年ほど前もこの事象が出ていました。(当時はwindows7 32bitでパソコン自体も今のパソコンと別の物です)
その時はそのままにしていて、それから自動返信の機能も使っていませんでした。
今回、やはり自動返信の機能を使いたいと思い、テンプレートも新規作成したものです。
text形式で作成しています。

3)さらに試してほしいのは、手動で返信メール作成したらどうなるか
→ 手動で返信した場合は、本文のみで返信されヘッダー部分は入りませんでした。

[quote="mujina"]・PrintingTools（1.3.0）
・Quicktext（1.5）[/quote]
Thunderbird 60 にとどまっているのは PrintingTools のためでしょうか。
どちらも関係なさそうですね。
[quote="mujina"]セーフモードで試しましたが、状況は変わりませんでした。[/quote]ということですし。

[quote="mujina"]今回、imgurを初めて利用しましたが、画像は見られますでしょうか？[/quote]
サイトの画像ページに行って見ることができました。
直リンクだとなお親切です。

[quote="mujina"]2)メニューボタン＞表示＞メッセージのソース (Ctrl+U) でどうなってるか確認してみてください。
→ スクリーンショットをとりました
.../Qx4hFMP[/quote][quote="mujina"]5)推測していてもわからないので、メールのソース（できればmboxファイル自体）を調べる必要があるでしょう。
→ スクリーンショットをとりました
.../igNeXhn[/quote]
2つ画像ありますけど、どちらも同じメールのソースですよね。
後の方が範囲広いので、前の方の画像は要らないです。
それで私の意図としては、後の方はできれば（送信済みトレイであれば） Sent ファイルを開いて、問題のメールの前後がどうなっているかを含めて調べてほしいということでした。

とりあえず、ご提示いただいた画像をちょっと加工して添付してみます。[attachment=0]メールソース.jpg[/attachment]ちょうど中ごろの行[code]>From - Tue Apr 14 15:01:58 2020[/code]に注目してください。

頭にメール引用の ">" が付いています。
これならメールの開始行ではなく、メール本文の一部として表示されるでしょう。
でも引用なら、Thunderbirdでは普通は色付きの縦棒表示になるはず…
やっぱり、よくわからないです。

┳
┃
┻
で示した範囲のヘッダー情報はどこから湧いてきたのでしょう？
数分前のタイムスタンプになってるので、受信した返信元メールなんじゃないかと思われます。

ということで、返信元メールのソースを調べてください。
あと、自動返信で使ってるテンプレートも怪しい気がします。
さらに試してほしいのは、手動で返信メール作成したらどうなるか、です。

EarlgreyTea様からの確認事項で保留になっていたものです。

1)入れている拡張機能の名称とバージョンを教えてください。
→ ・Lightning（6.2.9.1）
・PrintingTools（1.3.0）
・Quicktext（1.5）

2)メニューボタン＞表示＞メッセージのソース (Ctrl+U) でどうなってるか確認してみてください。
→ スクリーンショットをとりました
https://imgur.com/Qx4hFMP

3)現時点でできるアドバイスとしては、セーフモードをお試しください。
4)テストの際は組織名は入れずヘッダーに日本語を入れない方がいいでしょう。
→ 差出人情報に日本語を入れず、セーフモードで試しましたが、状況は変わりませんでした。

5)推測していてもわからないので、メールのソース（できればmboxファイル自体）を調べる必要があるでしょう。
→ スクリーンショットをとりました
https://imgur.com/igNeXhn


今回、imgurを初めて利用しましたが、画像は見られますでしょうか？
よろしくお願いいたします。

[quote="mujina"]→ これは受信メールのスクリーンショットです。[/quote]
受信側となると、そちらのソフトやサーバーなどいろんな条件に左右されるので、
送信済みトレイ（送信前の控え）でも現象が出るなら、
それを見るようにした方がいいです。

[quote="mujina"]→ 自動返信の内容文をテンプレートで保存し、メッセージフィルターの動作「テンプレートを使用して返信する」で送ったメールです。(ご質問の意味と相違していたらすみません)[/quote]
質問の意図とはずれていますが仕方ありません。
受信側のメールのようなので、そちら側の事情によるものなのでしょう。
また、返信対象の元メールになにか誘因があるということも考えられます。

[quote="mujina"]→ ImportExportToolsなどでmboxをエクスポートしたものを開いて中身を確認するということでしょうか？（「Thunderbird、mbox、ソース」などでネット検索しても方法を見つけられませんでした）[/quote]
メールのソースを見るのであれば、メールを開いた状態で Ctrl+U で見ることができます。

そして私がmboxファイルといっているのは、「メッセージの格納形式」がデフォルトの 「フォルダー単位 (mbox 形式)」の場合、フォルダーのメールのソースを1つに連結した、拡張子なしのファイルとして保存しています。
これを指したものです。

そのファイルは、各アカウント設定＞サーバー設定 の一番下、メッセージの保存先に設定されてる場所にあります。
受信トレイなら Inbox、送信済みトレイなら Sent です。
それをテキストエディターで開いて調べてほしいということです。

ただし、私のようにわざと書き換えて試すのでなければ、直接開くのはお勧めしません。
別の場所にコピーしてからにしましょう。
あと Thunderbird を終了させた状態でお願いします。