[color=#006600]＊質問・投稿する前に、サポートサイトやヘルプ、このフォーラム内を検索・閲覧して
　該当項目、同類・類似事例がないか、確認してみましょう。
　また、広くインターネット上でも、同類・類似事例がないか、調べてみましょう。
＊質問・投稿する前に [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum]フォーラムの利用について[/url] をしっかり読んで、その内容を理解
　した上で、それに沿って投稿しましょう。
＊ご自分の利用環境として、正確な OS の種類と Thunderbird のバージョンぐらいは
　書き添えましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後は、放置せずに、結果や経緯を必ず書くように
　しましょう。
＊ここは、相互ユーザサポートを通じて、各種情報・事例を、ユーザ同士でシェアする
　場でもあります。[/color]　
　
　
まず、操作手順の確認です。

メッセージペインを非表示・表示にするレイアウトは、
・[メニューボタンアイコン] > [オプション] > [レイアウト] > [メッセージペイン F8]
または、
・[メニューバー] > [表示] > [レイアウト] > [メッセージペイン F8]
でおこないます。 （Windows の場合）


次に、メッセージペインを非表示にしたレイアウトで Thunderbird を終了し、次に起動
した際には、終了時と同じ状態になります。
終了時の表示状態が記憶されて、メッセージペインが非表示状態のままとなります。
これは、仕様です。
[環境：OS:Windows 7 Professional SP1 + Thunderbird 31.4.0 日本語版]


希望の内容は、上記の例ではなくて、Thunderbird の終了時に、メッセージペイン表示
状態であっても、毎回起動時には、メッセージペインを非表示にしたいということでしょ
うか？
あるいは、Thunderbird の終了時のレイアウト状態にかかわらず、毎回起動時には、メ
ッセージペインを非表示にしたいということでしょうか？

もしそうならば、残念ながら現在の仕様ではできないかと思います。
それを可能にするアドオンがあればいいのですが、なかったように思います。


【大きなお世話】
製品名は、thunderbird ではなく、Thunderbird です。

[size=12][color=blue]※質問するときは、「フォーラムの利用に関するご案内」、とりわけ「質問するときは」に目を通し、OS の種類や Thunderbird のバージョンといった使用環境についての最低限の情報を書き添えることをお勧めします。[/color][/size]

Thunderbird の標準的な動作としては、[表示] -> [レイアウト] -> [メッセージペイン（F8）] の選択結果をはじめ、開いた複数のタブ、選択されたタブなどいくつかの状態を、セッション情報として保存します。
終了時にこれらの情報が正常に保存されていれば、次回起動時にその状態を反映してくれます。
したがって、[メッセージペイン] を非表示にしたまま終了すれば、次回起動時も [メッセージペイン] が非表示のままになるのが普通です。

そうならないとすると、どこかに問題が起こっているのかもしれません。

上記のセッション情報を保存しているのは、プロファイル内にある session.json というファイルです。
ご質問の文面から、今の時点で考えられることとしては、
（a）セッションが正常に保存されない。（終了時の障害）
（b）保存されたセッションを正常に読み込めない。（起動時の障害）
（c）セッション情報を保管したファイルが破損している。
（d）Thunderbird 以外の何者かが干渉している。
―― といったあたりが想像できます。

（a）（b）に関しては、入れているアドオンの動作不良が影響していることもありえますので、すべてのアドオンを無効化した状態でセッションが保存されるかどうか確認してみると、アドオンの影響の有無が判断できると思います。
（c）は、既存の session.json をいったん削除してみるという手があります。しかし、もし session.json を頻繁に破損させる原因が別にあるなら、それを突き止めないと本当の解決には至らないと思います。
（d）は（c）のバリエーションですが、でありがちなのは、システムのクリーニングを銘打ったソフトウェアで、Thunderbird のセッション情報がクリーニング対象として設定されているようなケースです。この場合、クリーニングソフトが実行されるたびに session.json が削除されるので、Thunderbird の表示状態がそのつど初期状態にリセットされます。

ほかにも原因はあるかもしれませんが、とりあえず以上です。的外れな話になっていたらすみません。

立ち上げてからツール→オプション→レイアウト→Ｆ8ペインのチェックを外すと、ペインが表示されないのは分かっていますが、立ち上げ時に固定的にペイン非表示をセットすることはできないでしょうか？どなたわかる方よろしくお願いします。