[color=#006600]＊ご自分の利用環境として、正確な OS の種類と Thunderbird のバージョンぐらいは
　書き添えましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後は、放置せずに、結果や経緯を必ず書くように
　しましょう。ここは、ユーザ同士で、各種情報・事例を、シェアする場です。[/color]　
　
　
[quote="kuniaki"]置き換わったメールの復元はできるのでしょうか？[/quote]
メッセージをソース表示して、実体内容を確認しても、置き換わっているのですね。
そうなると、Thunderbird で修復・復元することはできません。

サーバにメッセージが残っていたら、再度受信することで取り戻すことができます。

同様の現象が起きています。

対処方法の
１．最適化
２．フォルダ修復
３．要約ファイルの初期化
それぞれ試みましたが、勝手に置き換わった受信メールは本来受信されるべきだったメールには戻りませんでした。
置き換わったメールの復元はできるのでしょうか？

　
hidenari さんにお願いです。

どれを試して、どのような結果になったのかを、ぜひ教えていただけませんか。
それ以外にも、何か情報がありましたら、添えていただけませんか。

そうしていただくことで、他のユーザの皆さんにも有用な情報になり、シェアできることに
つながります。

[b][font=Lucida Grande, Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif][-WEBKIT-CENTER][highlight=#dee3e7]kiki さん[/highlight][/-WEBKIT-CENTER][/font][/b]
[b][font=Lucida Grande, Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif][-WEBKIT-CENTER][highlight=#dee3e7]
[/highlight][/-WEBKIT-CENTER][/font][/b]
[b][font=Lucida Grande, Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif][-WEBKIT-CENTER][highlight=#dee3e7]ご丁寧にありがとうございます。[/highlight][/-WEBKIT-CENTER][/font][/b]
[b][font=Lucida Grande, Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif][-WEBKIT-CENTER][highlight=#dee3e7]いろいろ試してみたいと思います。[/highlight][/-WEBKIT-CENTER][/font][/b]
[b][font=Lucida Grande, Verdana, Helvetica, Arial, sans-serif][-WEBKIT-CENTER][highlight=#dee3e7]助かりました。[/highlight][/-WEBKIT-CENTER][/font][/b]

　
[color=#006600]＊質問・投稿する前に、サポートサイトやヘルプ、このフォーラム内を検索・閲覧して
　該当項目、同類・類似事例がないか、確認してみましょう。
　また、広くインターネット上でも、同類・類似事例がないか、調べてみましょう。
＊質問・投稿する前に [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum]フォーラムの利用について[/url] をしっかり読んで、その内容を理解
　した上で、それに沿って投稿しましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後は、放置せずに、結果や経緯を必ず書くように
　しましょう。ここは、ユーザ同士で、各種情報・事例を、シェアする場です。[/color]　
　
　
何が原因で、そのようになるのか不明ですので、以下の対処を「順番」に試して、その都度、
改善されるか、確認してみましょう。

１．「最適化」を実行する。
　　メッセージの要約（インデックス）ファイルの、不整合が起きている可能性があります。
　　次のヘルプガイドを参照して、「最適化」をおこなってみましょう。
　　
　　[参照]
　　[url=https://support.mozillamessaging.com/ja/kb/compacting-folders?redirectlocale=ja&redirectslug=compact-inbox-or-other-folder]フォルダの最適化 | 操作方法 | Thunderbird ヘルプ[/url]

２．「フォルダを修復」を実行する。
　　「最適化」で改善が見られなかった場合は、メッセージの要約（インデックス）ファイル
　　の「フォルダを修復」です。

　　フォルダペインで、該当アカウントの「受信トレイ」や、問題の起きているフォルダを選
　　択して、右クリックします。
　　開いたメニューから [プロパティ] > [一般情報タブ] > [フォルダを修復] をクリックして
　　実行します。

　　[参照]
　　[url=http://www.mozilla.jp/thunderbird/support/kb/002635]メールのデータベースを再構築するには | Thunderbird サポート[/url]

３．メッセージの要約（インデックス）ファイルを初期化する
　　「最適化」「フォルダを修復」でも改善がなかった場合は、メッセージの要約（インデッ
　　クス）ファイルを初期化します。

　　まず、Thunderbird を終了した状態にします。
　　以下の場所にある、該当アカウント名フォルダ内の *.msf を削除します。
　　「受信トレイ」ならば、Inbox.msf です。
　　次に、Thunderbird を起動して、確認します。

　　[Windows 7 標準の場合]
　　・POP アカウント
　　　C:\Users\<ユーザ名>\AppData\Roaming\Thunderbird\Profiles\<profile folder>\Mail
　　・IMAP アカウント
　　　C:\Users\<ユーザ名>\AppData\Roaming\Thunderbird\Profiles\<profile folder>\ImapMail

　　[参照]
　　[url=http://support.mozillamessaging.com/ja/kb/profiles]プロファイル | 操作方法 | Thunderbird ヘルプ[/url]


[過去トピックの類似事例]
[url=http://forums.mozillazine.jp/viewtopic.php?f=3&t=13927]MozillaZine.jp フォーラム - [解決済み] 受信トレイのメール本文が文字化けしました[/url]
[url=http://forums.mozillazine.jp/viewtopic.php?f=3&t=13872]MozillaZine.jp フォーラム - 更新されたら過去の受診メールがすべてバグって読めなくなった。[/url]


[quote="hidenari"]もしかして、ウィルス感染したのでしょうか？
ちなみに、対策ソフトはSymantec Endpoint Protection 12.1.1000.157を使用しています。[/quote]
あくまでも可能性ですが、まったく関係ないとは断言できません。

念のため、Symantec Endpoint Protection や、他にも関与しそうなアプリケーションが、
Thunderbird に対応しているかどうかを確認しておきましょう。
また、設定が適切かどうか、今一度、見直しておくのもいいでしょう。


【大きなお世話】
Thunderbird 17.0.5 は、とっくにサポートが終了した、古いものです。
セキュリティ上も危険ですので、すみやかに、現時点での最新のバージョンに、アップデート
されるのをお勧めします。

Windows７でThunderbird17.0.5を使用しています。

突然、一部の既読メールの内容が書き換わってしまいました。
例えば、
１、HTML表記に書き換わる（内容は別メール）
<meta name=3DGenerator content=3D"Microsoft Word 12 (filtered medium)"> <style> <!-- /* Font Definitions */ @font-face =09{font-family:"Cambria Math"; =09panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;} @font-face =09{font-family:Calibri;
２、FBの通知メール内容に書き換わる
３、内容が消失する（中身がない）
４、意味不明なアルファベット、数字が数十行も羅列される（↓一部）　　
UEsDBBQAAQAIANWpb0NGSBZc2i4AAEA5AAAgAAAAgZlUREPS3cresIjql5eVXCgyMDEzLjEwgWAp Lnhsc3i4DeoWDLDmAWiBiWy76wfTUmsRZ2PROEWpxDeNnR4rS9DSbEEZ/PLDd01bL/MwP6AIjm7D OdLiRxorxOm8tRrHI830c9ltATt7d+xh2EluQEgMjOGS9qfdGn5ULLTLRfhlqYJER9ekPN0La0c2
=1B$B!!CfB<$G$9!#=1B(B =1B$BLd9g$;$"$j$,$H$&$4$6$$$^$9!#=1B(B =1B$B8e$,5M$^$C$F$*$j!"#1#7!'#3#0!]#1#8!'#3#0<B;\$H$J$C$?<!Bh$G$9!#=1B(B =1B$B!JA40w$G$N?)F2$d%*!<%W%s%9%Z!<%9$G$N<B;\$OHr$1$?$$!K=1B(B
５、既に削除されている別メールの内容に書き換わる
６、同じスレッド内なのに、正常なものと書き換わったものが混在する
７、2013/10/30以前の受信メールに影響はない
８、書き換わったメッセージには以下のようなものがついている
From - Wed Oct 30 08:46:03 2013 X-Account-Key: account1 X-UIDL: 119229.50af8342157e121915693c9cbc41c2b9 X-Mozilla-Status: 0008 X-Mozilla-Status2: 00000000 X-Mozilla-Keys: Delivered-To
－以上－

原因が全く分かりません。
また、書き換わってしまった内容を修復する方法もわかりません。

もしかして、ウィルス感染したのでしょうか？
ちなみに、対策ソフトはSymantec Endpoint Protection 12.1.1000.157を使用しています。

対処方法を教えてください。
宜しくお願いいします。