[quote="el"]●ツール→オプション で「ディスク領域を100KB以上節約できるときはフォルダを最適化する」にチェックをいれました。

●ファイル→フォルダの最適化 で最適化しました。[/quote]
了解しました。

[quote="el"]●各フォルダのプロパティの一般情報タブの「フォルダを修復」で修復しました。
　※古いメールが未読になったり、ならなかったりしたフォルダがありましたが
　　よくわかりません。（消していないメールも未読になったりしました）[/quote]
未読・既読の情報に不整合が起きていたらしいということかと思われます。

OS や HDD の状態から影響を受けるかも知れません。
その他にはセキュリティ対策ソフトに余計なことをさせないとか、フォルダの保管容量（通常は 4GB）
を超えないように注意するぐらいでしょうか。

[quote="el"]しばらく様子をみましたら、また報告させていただきますのでよろしくお願いいたします。[/quote]
どのくらいの量的・サイズ的なメッセージを扱っているのかは不明ですので具体的にはなんともいえま
せんが、削除したメッセージが復活することが無くなったら改善されたと見てよろしいかと思います。
　

ありがとうございます。

●ツール→オプション で「ディスク領域を100KB以上節約できるときはフォルダを最適化する」にチェックをいれました。

●ファイル→フォルダの最適化 で最適化しました。

●各フォルダのプロパティの一般情報タブの「フォルダを修復」で修復しました。
　※古いメールが未読になったり、ならなかったりしたフォルダがありましたが
　　よくわかりません。（消していないメールも未読になったりしました）

リンク先をたどっていろいろ読んだのですが、表示できないページとかもありましたので
もしかしたら大事なことが抜けてるかもしれません。
ご指導いただけましたらよろしくお願いいたします。

しばらく様子をみましたら、また報告させていただきますのでよろしくお願いいたします。

　　
「最適化」あるいは「フォルダを修復」を実行されたのでしょうか？
オプションで「最適化」の半自動化を設定されたのでしょうか？

しばらく様子を見ていただいた結果、改善されたかどうかの追記をぜひともお願いします。
理由：結果を書いていただくことでこのトピックの内容がより有用な情報になりうるからです。
　

kiki 様

返信ありがとうございます。
お返事が遅れまして申し訳ございません。

頂いたリンク先を確認しまして、しばらくまた様子を見てみようと思います。

とても助かりました、ありがとうございます。

　
これまでに「最適化」や「フォルダを修復」を適時実行されたことがありますか？

もしほとんどしたことがないのであれば要約（インデックス）ファイルに不整合が起きて
いて削除したメッセージが実際には削除されずに残っているものと思われます。

[参照]
[url=http://forums.mozillazine.jp/viewtopic.php?t=2023]過去に送ったメールが送られてくる[/url]
[url=http://webcache.googleusercontent.com/search?q=cache:DlwSAh3y45kJ:level.s69.xrea.com/mozilla/index.cgi%3Fid%3DCompactFolder+%E3%83%A1%E3%83%83%E3%82%BB%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%95%E3%82%A9%E3%83%AB%E3%83%80%E3%81%AE%E6%9C%80%E9%81%A9%E5%8C%96+-+%E3%81%88%E3%82%80%E3%82%82%E3%81%98%E3%82%89&cd=1&hl=ja&ct=clnk&gl=jp&lr=lang_ja&source=www.google.co.jp]Thunderbird のメッセージフォルダの最適化 - えむもじら[/url]
[url=http://webcache.googleusercontent.com/search?q=cache:YgtnlyEr-1sJ:level.s69.xrea.com/mozilla/index.cgi%3Fid%3DMessageDelete+%E3%83%A1%E3%83%83%E3%82%BB%E3%83%BC%E3%82%B8%E3%83%95%E3%82%A9%E3%83%AB%E3%83%80%E3%81%AE%E6%9C%80%E9%81%A9%E5%8C%96+-+%E3%81%88%E3%82%80%E3%82%82%E3%81%98%E3%82%89&cd=2&hl=ja&ct=clnk&gl=jp&lr=lang_ja&source=www.google.co.jp]Thunderbird のメッセージ削除の仕組み - えむもじら[/url]
　

【お勧め】
オプションで半自動化の設定にしておくといいでしょう。
　

はじめまして。 よろしくお願いいたします。

現在、２台のＰＣで、Thunderbird3.1.9　WindowsXP SP3を使用しております。
（２台とも同じです）

半年～１年前くらいにアウトルック2000から古いメールを
移行して使っています。

２台のＰＣで６つのメールアカウントを受信していまして、

１台目のＰＣ（デスクトップ）でつかっているThunderbirdは
５つのメールアカウントを受信していて特に問題はありません。

２台目のＰＣ（ノート）で使っているThunderbirdがメールアカウントを１つ受信しています。
たくさんメールが届くので古いメールや、迷惑メールを消しているのですが
ゴミ箱にいれて、カラにしたはずのメールが復活するときがあります。

どちらのＰＣもメールをサーバに残す設定にはしていません。

メールの多さでいうと、１台目のＰＣの方が多いのですが
１台目は異常がないので原因がわかりません。

いろいろ検索してみたのですが、他にこのような例が見つからず困っています。

どうかよろしくお願いいたします。