ご希望にそう回答ではなくて申し訳ないのですが......。

「イベントログの管理」（Activity Manager）は、Thunderbird 3.0 から取り入れられた新機能で、現状ではご希望に叶うほど多機能ではないと思います。
リリースノート↓にあるように、
http://mozilla.jp/thunderbird/3.0/releasenotes/
http://mozilla.jp/thunderbird/3.0.1/releasenotes/
現時点では、送受信ログの記録のほか、メッセージの移動・コピー・削除、グローバル検索の索引更新、IMAP の自動同期などの記録といったところでしょうか。
about:config から設定しようにも機能が実装されていないと無理ですから、ご要望の項目を記録する機能を追加してほしい旨、Mozilla の開発者サイドにリクエストを出すことから手をつけるしかない気がします。
[size=100]　　｜ 迷惑メールフィルタについては、現状で専用のログがとれますが、
　　｜ そうではなく Activity Manager に統合できないかという意味ですね？[/size]

アドオンは、空き時間にざっと探した限りでは見つけられませんでした。
ほとんど役に立たないコメントですみませんが、以上です。

Mozilla/5.0 (Windows; U; Windows NT 6.0; ja; rv:1.9.1.7) Gecko/20100111 Thunderbird/3.0.1 ThunderBrowse/3.2.8.1
です。

イベントログの管理をもっと活用したいのです。

現状では、私の環境ではImap-mailの更新と、ゴミ箱フォルダの削除以外デフォルトで記録されていないです。

イベントログでの管理をAbout config等で設定できるのでしょうか。
add-onで可能であればそれでもかまいません。

やりたいこと。

たとえば、
imap以外の受信メール数の記録
ステータスバーに表示される受信エラーの記録及びRssFeedの受信エラーの記録
最適化された時刻の記録。
迷惑メールフィルタ適用の記録