[color=blue]まず、ご質問の際はご使用の環境について、最低でも [b]OS の種類およびバージョン（Vista or Vista SP1）[/b]、
[b]Thunderbird のバージョン[/b] くらいはご記載いただきますようお願いいたします。
★ [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum]フォーラムの利用に関するご案内[/url] をぜひご一読ください。[/color]

以前、IME2007 ＋ InternetExplorer7 の組み合わせで同様の症状を見た事があります。
あくまで推測ですが、Thunderbird との相性で引き起こされる IME2007 側の不具合では
ないかという気がします。一度、以下のページをご参照、試してみてはいかがでしょうか？

[url=http://support.microsoft.com/kb/932102/ja]Office IME 2007 で入力した文字を漢字に変換できない場合の対処方法[/url]

漢字変換が出来ないので困っています。
入力し変換をすると、カタカナとひらがなの候補しか出力されません。
他のメールソフトで試すと出来るのですが、何か設定でもあるのでしょうか :?:
・環境
windows vista

：補足
オプションのフォントと文字エンコーディングの設定では、日本語になってます。