遅ればせですが、横から失礼します。
数日前から何度か投稿を試みたのですがスパム判定されて投稿できませんでした。もう一度内容を書き換え、一部を全角に置き換えて投稿を試みます。
リッツ さんが書きました:
Thunderbirdを起動すると、初期化されてるトラブルが頻繁に発生する 。
この「初期化」と仰っている症状は、参考として挙げておられるトピック「アカウント内容がすべて消えプロファイルを修復したい」で述べられているような状態を指しておられるのでしょうか。
すなわち、Thunderbird を起動したとき、メインウィンドウは表示されるがこれまで設定してあったアカウントがひとつもなくなっていて、アカウントの設置を促す画面が表示される、でも当該プロファイル内にはそれなりのデータが存在している、と...。
もしそうなら、
（1）profiles．ini は正常に読み込めていて、
（2）対象のプロファイルフォルダーも存在して認識されているが、
（3）そのプロファイルフォルダー内にある
（3-a）prefs．ｊｓが破損して正常に読み込めない
（3-b）中身がごっそり消去された
といったケースである可能性が高いと思われます。（他にも特殊なケースはあるかもしれませんが...。）
例示されているトピックは、CCleaner の動作不良により Thunderbird の prefs．ｊｓが破壊されたことに原因があった事例で、（3-a）のケースです。
似たような性格のソフトウェアの動作不良や設定ミス等によって、prefs．ｊｓに障害を与えるきっかけがあれば、同様の症状が発生します。
Thunderbird の稼働中にシステムがクラッシュしたようなとき、その巻き添えで prefs．ｊｓが破壊されるケースもなくはありません。
リッツ さんのところで問題が起こったプロファイル内に、Invalidprefs．ｊｓが存在するなら、prefs．ｊｓが破損したと考えてまず間違いないでしょう。
このような事例であれば、ご質問の現象が起こる直接の要因は prefs．ｊｓの破損でも、問題の本質は "prefs．ｊｓをくり返し破壊しているものは何か" です。
もしこの種のトラブルであれば、Thunderbird は一方的に干渉を受けているだけなので、Thunderbird 側でできる対処はほとんどないと思います。とりわけ、Thunderbird が終了しているとき、プロファイル内のデータに干渉してくるものがあるのなら、Thunderbird 側では対処のしようがありません。
既出情報の中では、CCleaner と同系ソフトである「Glary Utilitiesでのスキャン」が疑わしいと思われますが、Thunderbird のプロファイルを修復して正常に起動できることを確認したあと、再度スキャンをおこなっても初期化されることはなかったので、再現性を確認できない、というお話なのかと推測します。
たしかに、「Glary Utilitiesでのスキャン」の実行如何にかかわらず、「Thunderbirdを起動すると、初期化されてるトラブルが頻繁に発生する」ということであれば、原因を特定しにくいだろうと思います。
いまの段階で原因を作っているのが何者なのかはわかりませんが、
（a）Thunderbird のプロファイル、とくに prefs．ｊｓをターゲットにして干渉していること
（b）「初期化されてるトラブルが頻繁に発生する」頻度で干渉をくり返していること
といった仮説は立てられそうです。
（a）の観点
標準条件で Thunderbird をインストールした場合、プロファイルは既定の場所に置かれます。
クリーニングソフトの類は、各アプリケーションが持つこういう既定の場所をターゲットに動作するものが多いようです。
比較のため、同じローカルドライブ上の別の場所（例えば Documents 配下）に新しいプロファイルを作り、常用プロファイルの内容物を丸ごとコピーすれば、同じ内容のプロファイルを２つ用意できます。
既存の常用プロファイルで「Thunderbirdを起動すると、初期化されてる」が発生したとき、別の場所に作っておいたプロファイルを指定して問題なく起動できるのであれば、原因となる何者かは既定の場所をターゲットにしていることになるので、そういう初期設定を持って稼働しているソフトウェアの影響である可能性が高くなると思います。
（b）の観点
定期的か不定期的かはわかりませんが、くり返し実行されている何者かの干渉であることが推測できるので、そういうタスクを洗い出してみるのも一法かと思います。（a）の観点と突き合わせれば、少しは絞り込みやすくなるかもしれません。
「LibreOfficeのアップデート、windows update」が実行される頻度では、「頻繁に発生する」状態をもたらすには無理がある気がします。
とりえあえず以上です。役に立たない話だったらすみません。
（おことわり）
現在、健康上の制約により不定期な書き込みしかできなくなっています。すぐに応答できない場面がかなり多くなりますことを、ご容赦ください。
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