いえいえ、偶然的通行人さんのスタイルで当面回避できるわけですから、有益な情報ですよ。kiyo4_k さんもお書きになっていますが、ダイアログウィンドウをリサイズしなければ表示できますから。

バグですが、私は見つけられなかったのですが、どなたか見つけた方いらっしゃいますか？登録されていないっぽい？？

トピ主さんを置いといて話を続けてなんですが......。

kiyo4_k さん、Hide さん、ありがとうございます。多少なりともお役に立てているのならうれしいです。


先ほど、何気なく Mozilla Wiki を見てたら、Thunderbird 3.0 のリリース予定日が明記されていて、December 8 となっていました。（その通りになるかどうかは不明ですが...。）
このタイミングだと、おっしゃるように間に合いませんね。

その後、Windows XP SP3 上の 3.0rc3-candidates build1（ナイトリー）で、userChrome.css なしの状態で確認したのですが、フィルタの [有効] のチェック欄が、スクロールバーで隠れることはないものの、ウィンドウ・サイズを変化させると、消えたり現れたりする現象は再現しました。
いちおう、報告まで。

Thunderbird 3.0正式版がリリースされましたね。
残念ながら この現象はWindows 7（たぶんMacも）ではバグとして発現してしまいます。
XPもドラッグ開始と同時にサイズを計算するはずなので同じソースで元の値を間違っているならドラッグ中に表示がおかしくなると思います。

いろいろ数値を変えて試した結果、以下の設定で許せる動作になるようです。
36という数字の根拠は標準でのスクロールバー幅が16、チェックボックスが16、境界線が4（1+1+1+1）の合計です。
もちろん、WindowsやThunderbirdのテーマを変更している場合は違ってきますが、標準では少なくとも32ピクセル以上は計算違いをしていると思います。
残念ながらテーマを考慮した自動計算なんか出来ないので各自調整と言うことになりそうです。

userChrome.css

Mac 版では 38ピクセル以上でギリギリ、それ以上の数値を入れると呼び出した時点では表示できます。ウィンドウのリサイズをしなければですけど(^^;

　
検索してみたら以下が見つかりました。
Bug 518134 – Enabled column in Message Filters does not track dialog size properly

2009 年 9 月 22 日にファイルされていますので Thunderbird 3.0 b4 リリース前後頃
にはすでに報告されていたみたいですね。
　

Windows 7で再現しましたが、非常に困りましたね。

とりあえずデスクトップアイコンの右クリックで、互換性の"視覚テーマを無効にする"をチェック
入れれば、簡単に使えるようになりましたが、早めに対応してほしいです。