標記の件、ローカルフォルダに新着メッセージがないにもかかわらず、ツールバーに新着メッセージの表示が現れます。そして新着メッセージの数が増えていっています。
ツールバーの新着メッセージ数と実際のローカルフォルダ新着メッセージの数を一致させるにはどうすればよいのでしょうか。回答お待ちしています。

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ヤマ

ステータスバー(左下)に出て来る未読とか合計のところが「受信トレイ」のメッセージ数と合わないということですか。
で、毎度の事ながら・・・質問の際は OS と Thunderbird のバージョンを書いて下さい。
以下、Win 系 で Thunderbird　2.0系での説明になります。
実体と表示が異なっている場合に考えられる対処は以下。

1. フォルダを最適化してみる
最適化したいフォルダ(今回の場合は「受信トレイ」)を選択して右クリックのメニューから「最適化」をクリック。

2. フォルダのインデックスファイルを再構築してみる。
インデックスファイルを再構築したいフォルダ(今回の場合は「受信トレイ」)を選択して
右クリックのプルダウンメニューから「プロパティ」をクリック、
一般情報タブの「索引を再構築」をクリックして下のステータスバーに
「完了」が表示されるまで待ち、Thunderbirdを再起動。

"mozillaZine 日本語版について" のコーナーへも同一投稿がありましたので、そちらは削除しました。
誤って投稿した場合は、モデレータか管理人にPMで連絡もらえれば対処します。

回答ありがとうございました。
ご指摘のように「受信トレイ」だけでなく、ローカルフォルダにかかるすべてのフォルダに対して
最適化、及び再構築しましたが解決できませんでした。
新着メッセージのアイコンは右下隅に表示される時計の左隣に表示されるものです。
また、トップに表示されるローカルフォルダには新着メッセージ有りになっていますが、
「受信トレイ」だけでなくローカルフォルダにかかるすべてのフォルダには新着メッセージはありません。
OS：windows2000
Thunderbird　2.0.04
です。

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ヤマ

あー、Windows のツールバーってことですか、了解です。
私、普段は Mac なもんで(Win の環境もますが)、・・・悪しからず。

Thunderbird 起動時に自動で受信する設定にしている場合には
ツール -> アカウント設定で "そのアカウント" のサーバ設定で「新着メッセージがないか起動時に確認する」だけでなく
「新着メッセージを自動的にダウンロードする」のチェックが入っていないと、新着のお知らせはしますが、
新着メールをダウンロードしてきません、なので受信トレイにはなんも入ってきません。
設定を確認してみて下さい。

で、お知らせがあった新着メールをとりあえずダウンロードするには、
受信アイコン横の▼をクリックして「すべての新着メッセージを受信」をクリックしてみて下さい。



これ、誤記ですね。
正しくは、「ステータスバー(右下)に出て来る未読とか合計のところが」です。

お世話になります。
申し訳ありませんが、ツールバーの表示ではなく、タスクトレイに表示される新着メール案内のアイコンです。このアイコンにカーソルを合わせると新着メールの件数が表示されるのですが、ローカルフォルダに新着メールがないにもかかわらず、新着メールの件数が表示されます。

すんません、タスクトレイですね。

Windows XP の環境で確認してみました。
先にも書きましたが Thunderbird で起動時に自動で受信する設定にしている場合には
ツール -> アカウント設定で "そのアカウント" のサーバ設定で「新着メッセージがないか起動時に確認する」だけでなく
「新着メッセージを自動的にダウンロードする」のチェックが入っていないと
タスクトレイのアイコンをポインティングして新着メールの件数が表示されますが、
受信トレイにメッセージをダウンロードしません。
まずは、設定を確認して下さい。

とりあえず、受信アイコン横の▼印をクリック、「すべての新着メッセージを受信」をクリックして
新着メッセージをダウンロード出来ませんか?