件名通り、Firefox for iOS Ver.2.0で、ATOKキーボードが使えなくなりました。地球アイコンを押しても選択肢にATOKキーボードが出てきません。
Ver.1の時は問題なく使えていたと記憶しています。

iPhone５S　iOS9.2.1(13D15）Firefox for iOS Ver.2.0(2006)　ATOK for iOS Ver.1.4.8

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Mozilla/5.0 (Macintosh; Intel Mac OS X 10.11; rv:44.0) Gecko/20100101 Firefox/44.0

http://mozillazine.jp/?p=5057
先ほど公開したバージョン 2.0 のリリース紹介の記事にも書かせていただきましたが、バージョン 2.0 ではサードパーティ製のキーボードを利用することができません。
これはバージョンアップに伴うバグではなく、サードパーティ製キーボードに起因する複数の不具合を回避するために開発者が意図的に無効化したものです。
バージョン 3.0 において、サードパーティ製キーボードを有効化するかどうかのオプションが追加される予定です。

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[Desktop] Windows 10 Pro 22H2 (64bit) / Intel Core i7-2600 / Nvidia GeForce GTX 1650 GDDR6 / 32 GB Memory
[Laptop] Windows 10 Pro 22H2 (64bit) / Intel Core i5-520M vPro / Intel HD Graphics / 8 GB Memory
[Android] Android 13.0 (arm64) / Xperia 5 III (XQ-BQ42)
常用環境: Firefox ベータ版、リリース版 (Win64 x86-64, Android), Thunderbird ベータ版、リリース版 (Win64 x86-64)
テスト環境: Firefox (ESR, Nightly, Win64 x86-64, Android)
Cai/1.0 (Homo sapiens; N; Homo sapiens chemist; male; rv:0.0.4.2+)
-- いつまでたっても nightly