まず Ubuntu 9.04 はとっくにサポート期間が終了しています。
さっさとアップグレードするのをお勧めします。
(対応しているかどうかの確認はご自分でおこなってください)
[参考]
Ubuntuとは | Ubuntu Japanese Team
次に Ubuntu 9.04 では Thunderbird 3.1 系パッケージは提供されていなかったかも知れません。
ですのでそのままではアップグレードはできないかと思われます。
通常は Ubuntu 側でそのバージョンに合った Thunderbird のバージョンのパッケージが用意されて
おり、アップグレード方法もそれに従っておこなうようになっています。
これをパッケージ管理システムといいます。
つまり Ubuntu に適したものが Ubuntu 側で用意されているのです。
Mozilla 側で公開・配布されているものも使用することは可能ですが、あまりお勧めしません。
(その場合は PPA で公開・配布されているものがいいかと思います。)
[参考]
パッケージ管理システム - Ubuntu Japanese Wiki
ということで Ubuntu に関してはこのフォーラムよりも以下を参照されて日本語でサポートしている
各種 Ubuntu サイトなどを利用するのがいいでしょう。
コミュニティ | Ubuntu Japanese Team
Ubuntu Tips - Ubuntu Japanese Wiki
Ubuntu日本語フォーラム
#ちなみに製品名は THUNDERBIRD ではなく Thunderbird です。