以下のことをやるとメールが消えてしまいます。
解決方法を教えてください

親フォルダに、メールを入れても、大丈夫な方法（かも？知れないでもいいです）のみ、
レスください。

私のところでは消えません。Thunderbirdが作業中タイムアウトかファイルアクセスに躓いたかで途中でおかしくなっているのではないでしょうか。

私のところでは消えません。Thunderbirdが作業中タイムアウトかファイルアクセスに躓いたかで途中でおかしくなっているのではないでしょうか。
フォルダ選んだ右クリックで「プロパティ」、「索引を再構築」ボタンを押すと復活するかも知れません。

ただし、現状の私のThunderbirdでは「索引を再構築」ボタンを押したら またメニューが現れる確率が5回のうち4回という高確率です。アドオンが悪さをしていますね。

→　やってみましたが、ダメでした（泣）


回答を制限していますね、お見事です。

→　ありがとうございます（嬉々）


ところで、他で引用の仕方に苦労しているように見えます。返信するときに最初に「引用」ボタンを押せば引用文が[quoteなんとかで挟まれているので、それを上手に使ってみて下さい。
試しに他人の投稿に「引用」で編集状態にして見れば どんな風に使われているか見ることが出来ます。
そして、「プレビュー」ボタンで自分の文章の確認が出来ます。自分の文章を確認したときに、ついでに他人の堪に障るような余計なことを書いていないか確認してみて下さい。自分の堪に障るような部分は無視した方が余計なトラブルを回避出来ます。

→　やってみましたが、ダメでした（泣）

あれ？　じゃぁ、ファイルを消す方法を試してみますか。
今夜にでも調べますんで。

ひとつ忘れていました。まず以下を確認して下さい。

フォルダ選んだ右クリックで「プロパティ」、「保管ポリシー」の削除条件となる事象になっていないか確認してみて下さい。「既読のメッセージは常に削除する」という設定では移動した瞬間に消えるかも知れません。

＃ でも、これで消えていたとしたらメールの復活は難しいかも知れません。

⇒　確認しましたが、ラジオボタンはＯＦＦになってました

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あとは、メールフォルダの場所（プロファイルの中のMailというフォルダ）のローカルフォルダ使用・未使用で場所が変わるのですが、Inbox.sbd の中に あなたが作成した名前のフォルダが有るので、例えば「親フォルダ.msf」などという拡張子 msf のほうを削除しておいて次にThunderbirdを起動すれば自動的に再作成されるはずです。

＃ 保管ポリシーが原因だと期待して まずは簡単に書いてしまいました
フォーラムの検索で「msf」とか「受信 消え」とかをキーにするとたくさん（多すぎますけど）出てくるので、その中に詳しい説明が書いてあるものも有ったはずです。
すごいいいかげんで申し訳ないです。

受信トレイの直下にフォルダを作る（仮に、「親フォルダ」と呼称します）、
その親フォルダの下に、フォルダを作ります（これを、仮に、「子フォルダ」と呼称します）

受信トレイに来たメールを、親フォルダにマウスで移動させると、消えます。
子フォルダに移動した場合は、消えません。

親フォルダに、メールを入れても、大丈夫な方法（かも？知れないでもいいです）のみ、
レスください。

⇒　本日、娘の運動会なので、夜か明日にやってみます

⇒　プロファイルの中（念のため、Cドライブ全検索も検索）を探しましたが、「Inbox.sbd」ファイルが見当たりませんでした。

あれ？
私の場合、「ローカルフォルダ使用」でいくつかのアカウントを利用し、その他にIMAPのアカウントがいくつか有る状態で、
Thunderbird上のフォルダが見えるところではローカルフォルダ配下に受信トレイとか送信済みトレイとか その他のフォルダが見えている状態です。

プロファイルからMailまでは私はVistaなので以下のPathになっています（XPとは少し違いますが）
C:\Users\ユーザーID\AppData\Roaming\Thunderbird\Profiles\lmd3qtcm.default\Mail\
ローカルフォルダ使用の場合は、この中にLocal Foldersというフォルダが有り、
受信トレイに相当するファイルが Inbox と Inbox.msf の２つのファイルになります。
ちなみに他のフォルダの対応は以下です。
未送信＝Unsent Messages
下書き＝Drafts
送信済みトレイ＝Sent
迷惑メール＝Junk
ゴミ箱＝Trash
通常はこれらのファイルと対になる「.msf」との組み合わせで存在し、これらが存在するフォルダがローカルフォルダ使用でまとめた単位、あるいはローカルフォルダ未使用で設定したアカウントの単位に存在します。

この状態から受信トレイの直下にフォルダを追加した場合、もうひとつPathが作成されるのですが Inbox配下と言うことでPathが Inbox.sbd （おそらくsbdは Sub Directoryとかの意味でしょうけど） というPathに新しく作ったフォルダの名前のファイルが作成されます。以降、Thunderbirdでフォルダを内側に追加する度にPathが追加されます。

ここまで、わかりますか？　（チェックポイント１）

ここまで書いて気付きましたが、
「Inbox.sbd」ファイルが見当たりませんでした。」 と書かれているようにフォルダを探したのではなく、ファイルを探して見つからなかったのか、
フォルダとして探したけど無かったのか、

私は「Inbox.sbd の中に あなたが作成した名前のフォルダが有るので、」と書いたのでフォルダという認識で理解していると思うのですが、ファイルのつもりで検索したのならもう一度確認して下さい。

で、フォルダという認識で合っているとして、
Inbox.sbd というPathが無いということは 「受信トレイの直下」 というのは 「受信トレイの配下」 とは違うと言うことでしょうか？
Thunderbird上のフォルダが見える並びで言う 「受信トレイの下側」 ということですか？
もしそうなら、１つ上のPathであるLocal Foldersというフォルダの中に作成した親フォルダと同じファイルとPathが追加されているはずです。
例で言うと、
親フォルダとその配下に子フォルダ の場合、Local Foldersから、
Local Folders\親フォルダ
Local Folders\親フォルダ.msf
Local Folders\親フォルダ.sbd\
Local Folders\親フォルダ.sbd\子フォルダ
Local Folders\親フォルダ.sbd\子フォルダ.msf

こういう風になっていたら、以下のファイルを消す、かな。
Local Folders\親フォルダ.msf
Local Folders\親フォルダ.sbd\子フォルダ.msf

[⇒　エクスプローラーで確認したかぎり、ThunderbirdのProfilesフォルダは、USERディレクトリには、存在してない構成になってます（ちょっと不思議）。

会社のPCは不可視フォルダが見える設定で自分のはそうなっていないというオチでは？
ユーザディレクトリと言うより Documents and Settings というフォルダの中の Application Data フォルダの中に有ります。

じゃぁ、スタートメニューの「ファイル名を指定して実行...」で %appdata% と入れてエンターを押せば直接フォルダが開いて、そこに「Thunderbird」というフォルダが見えて その中を辿っていくと有るはずです。
エクスプローラで「見つからない」というのは不可視のままになっているとしか思い浮かばないんですけど。

ThunderbirdがXPと相性が悪いって事はないです。私も以前はXPでした。