いつもお世話になっております。
同様の現象を検索で見つけられませんでしたので投稿させていただきます。

メールボックスが4G近くになってしまいましたので
フォルダを作成して古いメールを移動しようとしております。
大量に移動するとメモリがみるみる減少して（最後は数10メガ程度）
最終的にはPCがフリーズしてしまいます。
2つのCPUは1～5％程度の使用率、HDDはフルアクセス状態です。
そうなった場合は強制終了もできず、
PCを物理的にシャットダウンして再起動となっています。

毎回手動で数件ずつ移動するのも面倒なので、メッセージフィルタの
「送信日からの日数」で自動的に移動するように設定してみましたが、
最も古い日時から10日分程度になるように日数設定して実行した場合でも
（おそらく500件程度かと思います）
数回に一回程度の頻度で上記のフリーズ現象が現れます。

原因がわかる方おられましたらよろしくお願いいたします。
当方のスペックですが、
PC:DELL core2 2.4GHz
メモリ：2GB
OS：windows vista Business
TB：バージョン 2.0.0.21
です。よろしくお願いいたします。

おそらく、メールボックスを肥大化させたのが原因でしょう。
すでに肥大化させてしまったものは少しずつ別の場所に移動させるとして、その後は適宜別の場所に振り分けたり定期的に最適化する等して肥大化させないように使ってください。

なお、最適化の最中に強制終了すると最悪メールが消失しますので、フリーズが予想される場合は特にプロファイルのバックアップを取ってから作業すると良いと思います。

オフトピと言う事で・・・。
Thunderbird を使用する上で知っていると役立つ留意事項をいくつか紹介しておきます。

Thunderbird のファイルサイズの注意点は以下トピを参照下さい。
Thunderbird の場合、各フォルダの最大サイズは4GBになります。
Thunderbird　のメール・添付ファイル最大保持容量はどのくらいでしょう？

あなたが以前質問された以下トピでのレスにファイルの削除に係る解説が成されていますが、
メッセージの移動も削除の動作に準じます。
ある期間のメールが消えてしまいました
あるメッセージをもと有ったフォルダから別のフォルダに移動した場合、
メッセージは移動したのではなく、別のフォルダにコピーが出来て、
メッセージがもと有ったフォルダでは UI 上で見えない様にフラグがついているだけです。
これで、メッセージがもと有ったフォルダ最適化をしてあげると
UI 上で見えない様にフラグがついているメッセージは削除されます。
従って、移動の動作においても最適化を実施しないと容量がどんどん増えて行きます。

受信トレイなどは一定間隔で定期的に受信する様に設定している場合、
大量のメッセージを別フォルダに移動している動作中に受信を開始するとフリーズしたり、
受信トレイに対応するファイルを破損したり、索引ファイルに異常を生じることがあります。

早速のご回答ありがとうございます。
やはりメールボックスをほったらかしにしていたのが
原因のようですね。
最適化はものすごく時間がかかるのでたまにしかしていなかったのですが、
こまめにメンテナンスしておく必要がありますね。
いい勉強になりました。

現在はとりあえずメモリの増強（4Gへ）して
少しずつフォルダわけを進めています。
何度か同様の症状がでていますが、PCはフリーズすることなく
サンダーバードだけが落ちています。
移動成功、エラーを繰り返しながら
地道にやるしかありませんね。
ありがとうございました。

差し出がましいかもしれませんが、今後の予防策ということで......。

> 最適化はものすごく時間がかかるのでたまにしかしていなかったのですが、
> こまめにメンテナンスしておく必要がありますね。

メールボックス／フォルダの肥大化はトラブルの原因になりがちですが、定期的な最適化はけっこう忘れてしまうものです。
そこで、これが便利ですよ。（いまの状態を解決されてからの適用になると思いますが。）
http://forums.mozillazine.jp/viewtopic. ... 50e81deded

作者を差し置いてでしゃばるのは申し訳ありませんが、壱ユーザーとしてお勧めします。