・メールの内容は、URLを含むものがおおいのですが、原則画像取り込みはOFFにしています。

まず、メッセージを大量に受信トレイなどに溜め込んでいるようでしたら「最適化」や
「牽引を再構築」をしてみてください。
＊フォルダを右クリックすればメニューの中にあります。

もし受信トレイ直下にサブフォルダを作ってメッセージを振り分け保存しているのなら
受信トレイと並行した場所にフォルダを移動されるのをお勧めします。
＊アクセスの度にファイルの書き換えを頻繁におこなうため、不整合が起こりやすい。

それでも改善が見られないようなら以下を試してみてください。
1.Thunderbird のセーフモードで起動。
2.新規プロファイルを作り、それを適用する。
3.クリーンインストール。
メッセージデータ、アドレス帳などが保管されているプロファイルフォルダはしっかり
バックアップを取った上でおこなってみてください。

ひょっとしたらウィルススキャン関連のアプリケーションの機能で負荷がかかって重た
くなっているのかも知れませんね。
そのあたりも確認した方がいいかもです。

セキュリティツールが お節介にURLを接続してチェックしている、ってことは無いですよね
＃ そういう機能がX64でバグが発症している、とか。

＃ 加えて、Dドライブが圧縮ディスク、とか

＜結論＞
・なんらかの理由で、メッセージフォルダ内の管理データ（正式な名称はわかりかねますが、
”Inbox”、”Inbox.msf”を含むディフォルト生成のデータ）に何らかの不整合が発生していたと
思われます。
・状況発生の根本原因は、不明ですが、以下2点のどちらかかと思います。
　１）侵入したウィルスの影響：可能性は低そうだが。
　２）OSインストール、Thunderbirdインストール後に、過去のメッセージデータを移行しようと
　して、私が何らかの操作ミスを行い、上記管理データ部分に不整合を発生させた。