旧PC（Windows XP）から新PC(Windows Vista)への移行で困っています。
Thunderbirdはどちらも2.0です。
複数のアカウント、フィルターの設定、また保存しているメールをできるだけ速やかに移行させたいのですが、どうすればよいか教えて頂けませんか？
よろしくお願いいたします。

すでに Vista の方にも Thunderbird をインストールされているということですね。

お引っ越しの手っ取り早い方法としては
Profiles が入っている Thunderbird デレクトリごと差し替えてしまうのがよろしいかと。

1. Thunderbird を停止した状態で、旧PC（Windows XP） の
　　C:\Documents and Settings\<ユーザ名>\Application Data\Thunderbird で
　　Thunderbird デレクトリを(リムーバブルドライブなどに)コピー。
2. Vista の方の C:\Users\<ユーザ名>\AppData\Roaming\Mozilla\Thunderbird の
　　Thunderbird デレクトリと旧PCからコピーした Thunderbird デレクトリを差し替えます。
　　こちらもThunderbird を停止した状態で行って下さい。
3. Vista の方の Thunderbird を起動します。

以下、同様と言うかそのものの事例があります。

mozillaZine 日本語版 フォーラム - XPからビスタへ引越
http://mozillazine.jp/forums/viewtopic.php?t=5601

# リンク間違っていたので訂正しました。

POCH様

無事、それもあっけなく移行が終了しました。適切なご指導、感謝いたします。
お手数をおかけしました。