（環境；WIN2000 SP4）
これまでは普通に使えていましたが、２，０にアップグレードした直後から
起動しても一瞬で終了してしまいます。
上書きインストールだったので、
今度はクリーンインストールをしても同じ結果になってしまいました。

で、しかたなくこれまで普通に使えていた１，５の方をクリーンインストール
したのですが今度はこちらも同じように起動直後に終了するようになってしまいました。

念のためプロファイルも削除して２,０と１,５をそれぞれインストールし直しても
変化無しでした・・・。

実行しても画面上では何も変化はなく、
タスクマネージャーの「プロセス」に一瞬だけThunderbird.exeが表われて
消えるといった状況です。

Thunderbird のセーフモードでも起動しませんか。
バージョンアップ前に入れていた拡張機能か、テーマが 2.0.0.0 に対応
していないために起こる現象のように推察します。

とりあえず以下をご確認ください。
不具合診断チャート - もじら組 Wiki

同じような、状態に陥った事があるので参考までに
C:\Program Files\Mozilla Thunderbird\components\compreg.dat
こいつに異常が有ると同じような、タスクマネージャに
プロセスとして一瞬表れて何事も無かった様に消えます。
compreg.datを削除して起動するとThunderbird 2.0.0.0に会うことが出来ました。

どうも、compreg.datは一度作成されると、更新処理は無いようです。
(無ければ作るが、有れば更新処理などはしない・・・が正解でした。修正しておきます<(_ _)>)

まあ、参考まで