でも迷惑メールはそのフォルダに入っても迷惑メールのマークはつかないので、手動で迷惑メールボタンを押しています。

「迷惑メールフィルタを実行」は何時つかうのですか？

迷惑メールフィルタの方は迷惑メールボタンだけでは学習されないのでしょうか。

インターネット接続をしていない時に迷惑メールボタンや迷惑メールフィルタ実行ボタンは有効ですか？

それでは迷惑メールフィルタ実行ボタンはクリックしなくても自動的に働いていると考えてよいのでしょうか。

迷惑メールであるかどうかを自動的に判定するにはまず学習させてやる必要があります。
迷惑メールフィルタが有効になっていてある程度学習できていれば受信時に自動的に判定
して設定したとおりに振り分けて（処理して）くれます。

それからもう一つ質問なのですが、メッセージフィルタでアドレス帳にないものを「迷惑メールフォルダに移す」に設定（こちらが上の順序）、またメッセージフィルタで宛先が「～＠～」のものを削除に設定していますが、削除されず迷惑メールフォルダに入ってきます。
受けとりたくない場合はどういう設定にすればよいでしょうか。

サーバーで削除はサーバー上にメールを残したくないのでできません。

なぜサーバー上に残したくないかというのは、上司がメールをサーバー上に残しておくと他の人にそのメールを見られる、あるいは取られる心配があるからとのことです。その辺の仕組みは私は詳しくわからないので。本当にその恐れはあるのでしょうか。

それから教えていただきたいのですが、メールフィルタの「メッセージを削除」というのはゴミ箱のフォルダに入るということですか？それとも削除されてそのメールは見なくて済むということなのでしょうか。

メッセージフィルタで本文に「無料」と入っているものは「メッセージを削除」に設定しているのですが、削除されず、迷惑メールのフォルダに入ってきます。もう一つの設定でアドレス帳以外のメールは迷惑メールフォルダへと設定しているからでしょうか？

それともこういった迷惑メールの文字はコードが違ったりするのでしょうか。