ThunderBirdでは記号の使用は許されていないのでしょうか？
他のシステムのパスワード設定もあり、できることならThunderBirdでも記号が使えるようになるとよいのですが・・

もしくはサーバの制限で利用できない記号がある場合があります。
そのあたりも確認してみてください。

いやぁ、サーバーの制限がある場合には そもそも そのような記号を含むパスワードを登録できないのではないかと思います。
サーバー側から見ればホワイトスペースや制御文字とか見えない文字はダメだと思いますが、その他のascii文字は大丈夫だと思うんですが。
見える文字で制限文字ってありましたか？　（プロバイダローカルなら有るかも知れませんね）

もうひとつ、
user.jsやpref.jsの中にデータとして「"」を書きたい場合には「"」（\は円記号）というようにエスケープしなければならないといったことが有ります。まさかパスワードにエスケープを意識しなければならないなんてことは無いと思いますが、いったいどんな特殊記号を使っているのでしょうか？　（と問うても答えを聞くわけにもいかないし、書いてもらっても困るのですが．．．）
これが原因なら「\」や「"」はダメかもしれませんね。

パスワードはsignons.txtに保存されています。（1.5やtrunkの場合）
1.0.xでは********.sだったかな？
pref.jsに保存されているわけではないのでエスケープは関係ないと思います。

情報ありがとうございます。
私の場合は xxxxxxx.s でした。1.0.xからずっと使っているからでしょうか。
この中身を見ると「~」（チルダ）から始まって「=」で終わったり、アカウントの終了が「.」だったり、
「~」（チルダ）や「=」や「.」はマズいかもしれませんね。

よく見ると異なるアカウントでもパスワードが同じものは同じ文字列になっています、最低ですね。「フムフム、このアカウントと同じパスワードだな」などと予想できる情報を与えるだけでマズいと思います。
せめて他の情報と絡めて暗号化して欲しいですが。（他のソフトはそうなっているもののほうが多い）

確かにそうですね。僕のところも同じ文字列が並んでました :shock:
鍵として*.dbだけじゃなくてアカウント名も使うようにするといいのかもしれませんね。
Bugzillaに投げようにも大元のアルゴリズムを理解してないからお手上げです :(