１３．０１にバージョンアップしましたが、表示方法はメッセージの内容を下半分。うえは到着しているメールの一覧が表示されています。これまでいらないメールをその下半分の上半分と境のバーに表示されていました丸いマークをクリックするとメッセージが削除できたのに今回しようとすると丸いマークがありません。いちいち右クリックで削除するのでしょうか。

御使用の環境(OS)が不明なのですが､
そのボタン類が配置されている該当エリアで､
右クリック をした際に『カスタマイズ...』と云うのが 表示されませんか?

それを､選ぶと ､そのエリアの アイコンの初期化やカスタマイズが可能となります｡
もし､再配置出来るのなら行い､
或いは､『初期設定に戻す』を押すと､如何でしょうか?

(※ 当方 Mac 環境しか無いので､Winだと 表現とか異なっているかもしれませんが､
そこは､ご愛嬌って事で 宜しくお願いします^_^; )

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[ macOS 15 Sequoia] iMac (27-inch, 2019) Intel Core i5 3.0GHz, Built-in SSD 512GB, RAM 40GB

もしかして、ヘッダペインの最上段に有る進入禁止標識アイコン（丸に斜め線有り）の削除ボタンのことを書かれてます？
Thunderbird 13.0.1になったというだけでは変わっていませんけど。
なにかのアドオンのせいでは？

Ryoさま、おっしゃるとおり。メッセージの出ている一番上、ちょうど境のところでダブルクリックすると私の言っている状態にバーがなりまして無事に削除できましたありがとうございます。