次期バージョン 3.1 へ向けての開発版 Thunderbird 3.1b2pre で Quick Filter Bar が追加されました。
Mozilla/5.0 (Windows; U; Windows NT 5.1; ja; rv:1.9.2.5pre) Gecko/20100422 Lanikai/3.1b2pre

従来の絞り込み検索バーと少し似ています。

　　　スレッドペイン上部右端のタブ一覧ボタンの隣にクイックフィルタバー開閉ボタンが追加されます。
　　　

　　　開閉ボタンをクリックするとクイックフィルタバーがスレッドペイン上部に出現。
　　　左端のピンアイコンではアカウントやフォルダをまたいでファイル条件を維持するかしないかをトグル操作で切り替えます。
　　　

　　　フィルタ文字列を入力すると対象フィールドを複数または切り替えできます。
　　　

　　　スレッドペインの横幅が大きいときはデフォルトのフィルタ条件名がアイコンと一緒に表示されます。
　　　


Thunderbird 3.0 系では以下のアドオンで試すことができます。
Quick Filter Prototype :: Add-ons for Thunderbird