３．６にアップデートしたら、　右クリック→新しいウインドウで開く（W)　が使えなくなってしまいました。
ファイル（F)→新しいウインドウ（N）　も機能しません。
ＯＳはＶＩＳＴＡです。
何か特別な設定があるのでしょうか？

アドオンに絡んで不具合が生じたか、プロファイルがおかしくなったかでしょう。

アップグレード後など、調子がおかしいときは、以下を実行してください。
http://wiki.mozilla.gr.jp/wiki.cgi?page=chart

palさん、ご回答ありがとうございました。m(_ _)m

アドオンの “Fast Video Download”　を無効化したところ治りました。