上書きでもだいじょうぶですが、不具合が生じる可能性があります。(上書きした場合でもブックマークは残ります。)

最低限ブックマークをバックアップし、Firefox本体を削除、プロファイルも全て削除、改めて1.5.0.1をインストール、プロファイルの作り直しをすることをオススメします。
ブックマークは新しいプロファイルの中にコピーすれば復活します。

プロファイルについては下記。
http://www.mozilla-japan.org/support/firefox/profile
ブックマークはこの中にあるbookmarks.htmlというファイルです。