こんばんは。Firefox 1.0.7を使っています。Newsmonsterという拡張機能をいれたあと、Firefoxが起動しなくなってしまったので、Firefoxのフォルダから当該機能を直接削除したのですが、その後マウスホイールを操作してもスクロールしなくなってしまいました。いろいろ試してみたのですがうまく動作せず、またFirefox自体も不安定になってしまったのでアンインストールをして再インストールをしてみたのですが、なぜか設定ファイルそのほかがすべて温存されているらしく、まったく同じ状態で復活しています。
おそらくThunderbirdを一緒にインストールしているからなのかもしれませんが、
Thunderbirdはメインのメーラーなのでいじりたくないのです。Firefoxだけ
キレイに再インストールできないでしょうか。アンインストールはコントロールパネルから行い、そのあとフォルダごと削除しています。

環境 Windows XP (パッチなどは全部あててます)
マウス:Intelli Mouse Explorer 4.0(IntelliPointの最新版インストール済み)
Mozilla Thunderbird 1.6a
＃hotmailを受信するために古いverにしたのですが勝手に最新版になって
しまったみたいですね・・・何度もアップデートウィンドウがでるから
押してしまったのかな。

Thunderbirdは関係ありません。
Mozillaのソフトは本体とは別にプロファイルを保存しているため、本体の再インストールだけでは不具合は解消しません。
プロファイルフォルダについてはMozilla Japanのサイトに詳しい説明があります。
http://www.mozilla-japan.org/support/firefox/profile

「Firefoxのフォルダから当該機能を直接削除した」というのがよくわかりませんが（拡張機能マネージャを使わずプロファイルフォルダのextensionsから直接削除したのでしょうか？）、おそらくこれが原因でFirefoxが起動しなくなっているのだと思います。
拡張機能が原因で不具合が起きた場合には、FirefoxをSafe Modeで起動することをお勧めします。
Safe Modeでは拡張機能やテーマがすべて無効化された状態で起動されるため、これらによる不具合は起こりません。
この状態で問題の拡張機能を拡張機能マネージャから削除してやればOKです。

不安定な状態の解消ですが、新しくプロファイルを作り直すのがいちばん簡単です。
Firefoxのプロファイルマネージャを起動して新しくプロフィルを作成し、必要に応じてbookmarks.htmlやcookies.txtを移動するのがよいと思います。

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[Desktop] Windows 10 Pro 22H2 (64bit) / Intel Core i7-2600 / Nvidia GeForce GTX 1650 GDDR6 / 32 GB Memory
[Laptop] Windows 10 Pro 22H2 (64bit) / Intel Core i5-520M vPro / Intel HD Graphics / 8 GB Memory
[Android] Android 13.0 (arm64) / Xperia 5 III (XQ-BQ42)
常用環境: Firefox ベータ版、リリース版 (Win64 x86-64, Android), Thunderbird ベータ版、リリース版 (Win64 x86-64)
テスト環境: Firefox (ESR, Nightly, Win64 x86-64, Android)
Cai/1.0 (Homo sapiens; N; Homo sapiens chemist; male; rv:0.0.4.2+)
-- いつまでたっても nightly

すばやいお返事ありがとうございます。
ちょっと紛らわしい書き方をしてしまったかもしれませんが、
現状での問題はマウスホイールが動作しないことと不安定なことなんです。
プロファイルを新規作成してみたところ、不安定なのは改善されたようにおもえるのですが、マウスホイールが引き続き動作しません。なのでプロファイルの部分も含めて
削除してクリーンインストールしてみたんですが、それでもまだマウスホイールが
動作しません。レジストリなどにfirefoxの足跡が残るようでしたらそちらも
削除してもう一度インストールしてみたいのでお願いします。

以下お試し下さい。
・マウスドライバーを最新のものにする。
・マウスドライバーの設定を念のため確認する。