正確に覚えてないので申し訳ありませんが、何ヶ月も前から起こっていることなので、最新バージョンからいくつも前のバージョンです。
プラグインのバージョンについても同様です。名前は、Shockwave Flashです。

このプラグインを使っている特定のサイトだけ、Yahoo! JAPANで特に表示されます。起動が重いときです。

これは何ヶ月も前から古いバージョンのFlashプラグインを使用されているということでしょうか？

ふだんはFlashプラグインをアドオンページで「実行時に確認する」設定にしておき、映像を見たりする場合だけその都度実行を許可するようにすることをおすすめします。そうすれば、必要ない広告などでページの表示が重くなったり不正広告によるリスクなどを軽減することにつながります。