新しいウィンドウが開かれると、メインになってしまう感じです。
そのため、その新しいウィンドウを閉じると元々使っていたページも閉じられて起動しなおさねばなりません。
しかし、オプションにはそれらしきものはなく、また、「複数のタブを閉じる場合は確認」に、チェックが入っていました。

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Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; WOW64; rv:34.0) Gecko/20100101 Firefox/34.0

別のトピックにも書きましたが、どのようなトラブルであっても、
それぞれについて「基本的なトラブルシューティング」を行って原因の切り分けを行ってください。
https://support.mozilla.org/ja/kb/troub ... x-problems

既に行った後であれば、それぞれの手順での結果を書いてください。

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Mozilla/5.0 (Macintosh; Intel Mac OS X 10.9; rv:35.0) Gecko/20100101 Firefox/35.0