firefox6及びB7をMacOS10.6.8で使用しておりますが。印刷PDF出力で完全に保存できません（1部だけ保存）解決策をお願いいたします。
safari,chromeは正常に動作します。

Mac OS X 10.6.8/Firefox 6 でいくつか試してみました。
お書きの状況は再現できなかったのですが、Planet Mozilla などから保存した PDF が、プレビュー.appで開くことができませんでした。これが同じ問題なのかは解りませんが…

解決策ではないですが、プリントダイアログの Preview ボタンからプレビュー.appを経由しても正常に出力されないでしょうか？
または Acrobat Pro や Reader をインストールしていらっしゃれば、そちらから出力するとどうでしょうか？（当方では Acrobat Pro 経由であれば正常に書き出せています）

ちなみに、Nightly Firefox 9a1 は正常に書き出せていますので、もしかすると Firefox 8 以前のバージョンで発生する問題かもしれません。
また、Mac OS X 10.7.1 では発生する場合もありますが、使用するプリンタドライバを変更すると正常に書き出せています。