3.6.12を使用しています。
サイドバーにブックマークを表示しているのですが、背景が薄いブルーで、選択している部分が薄いグレーという色で、どこを選択しているのか見分けにくく、時々困っています。

どこかで色設定を変更できないものでしょうか？
お教え願えれば幸いです。

　
＊質問・投稿する前に フォーラムの利用について を読むのをお勧めします。
＊環境として OS の種類ぐらいは書き添えましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後には結果や経緯を必ず書くようにしましょう。



Firefox のテーマはデフォルト（初期状態）のままですか？
何かテーマを入れていますか？
また OS のデスクトップのテーマ（スキン）によっても影響を受ける場合がありますがカスタマイズ
していますか？（OS は何ですか？）


標準ではブックマークのサイドバーの背景色などを変更する機能はありません。
userChrome.css というファイルに記述して変更（カスタマイズ）することができます。
以下の過去トピックを参照して試してみてください。
[解決済み]サイドバーの背景色について