私も説明不足な点について nonnon さんにお尋ねしたいところですが、
とりあえず[quote="nonnon"]バックアップしているプロファイルAのMailフォルダ（pop）のaaa.comフォルダの中のメールを復元（参照）したい[/quote]という目的に沿って回答致します。

まず、プロファイルやアカウント設定をいじる必要はないし、下手にいじると現在の環境を破壊する可能性があります。
やりたいことは[b]古いメールを閲覧することだけ[/b]のはずです。
すでに、現行のプロファイルBからバックアップのプロファイルAに切り替えてサーバーに接続とかしちゃってるようなので心配です。
それをやる前のバックアップは取られたのでしょうか？

ということで、元のプロファイルBに戻してください。
そして、古いPOPアカウントのメールデータをしかるべきメールフォルダーにインポートしてやるだけでよいのです。
そのメールフォルダーは、とりあえず「ローカルフォルダー」アカウントの下に作っておきましょう。
例として、ローカルフォルダー直下にインポート先のメールフォルダー import を作ることとし、以下手順を説明致します。

[list=1]
[*]Thunderbirdのフォルダーペイン（フォルダー一覧画面）にて、ローカルフォルダーを右クリックして「新しいフォルダー」を選択、import フォルダーを作成
[*]作成された import フォルダーを右クリックして「新しいサブフォルダー」を選択、任意の名前のサブフォルダーを作成
[*]メニューボタン > ヘルプ > トラブルシューティング情報 > 「フォルダーを開く」ボタンにて、エクスプローラーでプロファイルフォルダーを開く
[*]Thunderbirdを終了
[*]プロファイルフォルダー > Mail > Local Folders > import.sbd を開く
[*]別のエクスプローラーで「バックアップしているプロファイルAのMailフォルダ（pop）のaaa.comフォルダ」を開く
[*]その中身を全部コピーし、プロファイルフォルダー > Mail > Local Folders > import.sbd の中に貼り付け
[*]貼り付けたうち、filterlog.html、msgFilterRules.dat、popstate.dat などはメールデータ以外のファイルなので削除
[*]Thunderbird を起動[/list]　
これで、ローカルフォルダーのimportフォルダーで古いメールが見られるようになっているはずです。

nonnon さん、maji です。
お困りな状況がいまいち判らないので
以下 2点ほど質問させてください。

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その１。

[quote="nonnon"]バックアップしているプロファイルAのMailフォルダ（pop）のaaa.comフォルダの中のメールを復元（参照）したい[/quote][quote="nonnon"]プロファイルAではImapでも123＠aaa.comを取得していた[/quote]
そのバックアップされた「プロファイルA」には
POP と IMAP の二つ別々のアカウントが作ってあった
とゆ事でしょうか？

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その２。

[quote="nonnon"]上記の状態で、プロファイルAのフォルダを丸ごとコピー、
profiles.ini内のプロファイルをプロファイルBからAに変更した時、
Imapにてメールが復元されてしまい、メールの件名などは戻るがメールの中身が閲覧できず、
セキュリティ認証すると既存のサーバー（新サーバー）からのデータが上書きされてしまいます。[/quote]
旧サーバ(解約済)対応のプロファイルA の 123＠aaa.com の IMAPアカウントの
IMAPメールサーバの
・サーバ名
・ユーザ名
・パスワード
は
新サーバ対応のプロファイルB の 123＠aaa.com の IMAPアカウントの
IMAPメールサーバの
・サーバ名
・ユーザ名
・パスワード
と
同じものですか？

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では。

過去のPOPメールを復元したい


＞＞やりたいこと
バックアップしているプロファイルAのMailフォルダ（pop）のaaa.comフォルダの中のメールを復元（参照）したい
（aaa.comフォルダはメールアドレス123＠aaa.comのメールが入っている）


＞＞状況

1.
現状のサンダーバードで、プロファイルBにて、Imapで123＠aaa.comのメールアドレスで受信している

2.
123＠aaa.comのメールは新旧2つのサーバーでメールを受信していて、戻したいプロファイルAのメールは旧サーバーのもので
旧サーバーはすでに解約しており、サーバーからの復元はできない

3.
プロファイルAではImapでも123＠aaa.comを取得していた


上記の状態で、プロファイルAのフォルダを丸ごとコピー、
profiles.ini内のプロファイルをプロファイルBからAに変更した時、
Imapにてメールが復元されてしまい、メールの件名などは戻るがメールの中身が閲覧できず、
セキュリティ認証すると既存のサーバー（新サーバー）からのデータが上書きされてしまいます。


※新旧いずれもwin10を利用しています



＞＞教えていただきたいこと
上書きされることなくpopメールを閲覧する方法がありましたらご教示いただけましたら幸いです。
何卒宜しくお願い致します。