偶然的通行人様
コメント有難うございました。
当方でもFirefox/Thunderbird 49.0b1(日本語版)での事象再現を確認しました。
また、Bugzillaの方を確認したところ、以下を見つけました。
https://bugzilla.mozilla.org/show_bug.cgi?id=226301Firefoxの45.x 系で、バグが復活している旨のコメントがあります。
併せてFirefoxだとF7キー(キャレットブラウズモードのON/OFF)が有効という記載がありますが、
ThunderbirdではF7キーで「スペルチェック」になるので、キャレット復活はしないようです。
Thunderbird 51.0a1(英語版)で改善したということであれば、
解消したバージョンがリリースされるまで待つ必要があると考えました。
しばらくは、Thunderbird 45.4.0以降がリリースされる度に、
事象が解消されているか確認しようと思います。