[size=12][color=blue]※質問するときは、「フォーラムの利用に関するご案内」、とりわけ「質問するときは」に目を通し、OS の種類や Firefox のバージョンといった使用環境についての最低限の情報を書き添えることをお勧めします。[/color][/size]

ご利用の環境条件が不明ですが、当方の環境（Windows 7 / 8 の 2 種類）では、Firefox 43.0 系でご質問のような症状には出くわしていません。

Firefox 43.0 系でブックマークまわりに大きな仕様変更があったという話は寡聞にして存じませんが、一般論としていえば、Firefox のバージョンが上がったとき、既存のアドオンが新しい Firefox に十分対応していなくて、思わぬところに影響が出ることはあります。

さしあたり、トラブルシューティングの定石である次のことを確認なさってみてはいかがでしょうか。
（参考）・基本的なトラブルシューティング
https://support.mozilla.org/ja/kb/troubleshoot-and-diagnose-firefox-problems

とりあえず以上です。的外れだったらすみません。

最近、ブラウジングしていてある程度経過するとサイドバーの「未整理のブックマーク」が表示されなくなる現象が起きてます。
再起動すれば直るのですが、時間がたつとまた元通り。
４３になってからの症状のようなんですが、なにか仕様の変更があったのでしょうか？