[color=#006600]＊質問・投稿する前に [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum]フォーラムの利用について[/url] を読むのをお勧めします。
＊環境として OS の種類、Thunderbird のバージョンぐらいは書き添えましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後には結果や経緯を必ず書くようにしましょう。[/color]


[quote="Mtokura"]この文面でご理解頂き、ご回答頂ければ幸いです。[/quote]
どのアプリケーションで起きている問題なのかの記述がないのに理解して回答をくださいと
いうのはちょっと傲慢ではと受け取られるかも知れません。
投稿されているカテゴリフォーラムも "MozillaZine.jp について" になっていますので場違い
です。
＊モデレータの方が適切なフォーラムに移動処理をされるでしょう。


おそらく Thunderbird での出来事だと推察します。

可能性として考えられるのは以下です。
１．要約ファイルに不整合が起きているために見えないようになっている。
２．フォルダペイン（左側）をスマートフォルダ表示にしているためにそのように見える。
３．その他
　
おそらく ２．ではないかと推察します。 　
フォルダペインの表示スタイルを「すべてのフォルダ」にしたらどうなりますか。
　

恐れ入りますが、教えて頂きたい事があります。

受信ファイルに新しいメッセージが届いた後、別のファイルへ移動して
改めて受信ファイルに帰ってきたら、何と！！
先程、受信したはずの新しいメッセージが消滅しています。
ゴミ箱もしくは迷惑ファイルに入ったのではと考えて、見ても
移行された痕跡は全くありません。
先程、受信したファイルはいったい何処に行ってしまったのでしょうか？

この文面でご理解頂き、ご回答頂ければ幸いです。