ファイル->フライン->オフライン設定->ディスク領域->「ディスク領域を[　] KB以上節約できるときはフォルダを圧縮する」のチェックを外します。

「フォルダを圧縮」の意味は理解していますか?
「フォルダを圧縮」は定期的に行った方が無難です。
以下ご参照。

メール削除のしくみ
http://level.s69.xrea.com/mozilla/tips.html#delete_mail
メッセージフォルダの圧縮
http://level.s69.xrea.com/mozilla/tips.html#compact_this_folder

Mozilla Thunderbirdを使用していると、「確認」と題するメッセージが頻繁に現れて「ディスク領域に保存したすべてのローカルおよびオフラインフォルダを圧縮しますか？」と聞いてきます。このメッセージが現れないようにしたいのですが、どうすれば良いでしょうか。