[quote="さんさん"]ハードウェアアクセラレーション機能を無効にしたら、各フォルダのメールが元通り見られるようになり、送信したメールも送信済みトレイに残るようになりました。[/quote]
なんと！ハードウェアアクセラレーション機能を無効にしただけで各フォルダーのメッセージリストの表示が正常化したとは。
メッセージリストからメールが消えた現象が起きていたPC（Windows 10と11だったはず）には、ハードウェア上の共通点でもあったのでしょうか。
不思議です。

EarlgreyTea様、ありがとうございます。
トラブルシューティングモードで問題が起こらない場合、を確認して、ハードウェアアクセラレーション機能を無効にしたら、各フォルダのメールが元通り見られるようになり、送信したメールも送信済みトレイに残るようになりました。

アドオンは何も入っていなかったです。
テーマはシステムテーマになっていました。
直前に行った操作を思い返してみたのですが、お客さんの情報を探すために古い受信メールを見ようと、サブフォルダをクリックしただけだったと思います。
そこに入っているはずのメールが1件もなくて、びっくりして他のフォルダも見てみると、やはり空になっていました。

定期的なバックアップをしていなかったので、本当に肝が冷えました。
復旧できて助かりました。原因はよくわからないままですが…
ありがとうございます。

さんさん さん、EarlgreyTea と申します。

[quote="さんさん"]古いメールを確認したくて、何かサブフォルダをクリックした瞬間だと思うのですが、すべてのフォルダのメールが消えてしまいました。[/quote]
さすがにフォルダーを開いただけでそのようなことが起きるとは思えません。
その前に行った操作等がきっかけで起こったことが、フォルダーを開いたことで表示に反映されたと考えるのが自然です。
何か心当たりはないでしょうか。

[quote="さんさん"]トラブルシューティングモードで起動するというのを試したところ、各フォルダのメールが表示されるようになりました。
送信済みメールもトレーに表示されました。[/quote]
それでは、下記ヘルプ記事の「トラブルシューティングモードでは問題が起こらない」の項を参考に、問題の切り分けを行ってください。
[url=https://support.mozilla.org/ja/kb/troubleshoot-mode-thunderbird]Thunderbird のトラブルシューティングモード | Thunderbird ヘルプ[/url]

[quote="さんさん"]トラブルシューティングモードにするとき、アドオンの無効とツールバー・コントロールバーのリセット、にはチェックをしないで、トラブルシューティングモードにしています。[/quote]
そのチェック項目は一時的ではなく、普通に起動した場合にも無効化されるように設定に反映するものです。[attachment=0]トラブルシューティングモード.jpg[/attachment]
[quote="さんさん"]アドオンは何か入れた記憶がないので、メニューのカスタマイズ？などが影響しているのでしょうか？[/quote]
記憶ではなく、しっかりと確認をお願いします。
上で貼ったヘルプ記事の「トラブルシューティングモードで無効化されるもの」の項をご覧ください。

作成者です。追記です。
Windows11への切り替えのために準備していた新しいPCにサンダーバードをインストールし、プロファイルは、現象の起こっている古いパソコンからコピーして上書きしたところ、メールが一部しか残っていない、メールを送信しても送信済みトレーに残らない、と、同じ現象が起こっているのですが、トラブルシューティングモードで起動するというのを試したところ、各フォルダのメールが表示されるようになりました。
送信済みメールもトレーに表示されました。
トラブルシューティングモードにするとき、アドオンの無効とツールバー・コントロールバーのリセット、にはチェックをしないで、トラブルシューティングモードにしています。
アドオンは何か入れた記憶がないので、メニューのカスタマイズ？などが影響しているのでしょうか？
使い勝手がいいように表示するボタンを変更しているとか、自動で受信メールを振り分ける、くらいしか、設定していないのですが。

Windows10 Proのパソコンです。
サンダーバードは140.4.0esr、最新バージョンと表示されています。

古いメールを確認したくて、何かサブフォルダをクリックした瞬間だと思うのですが、すべてのフォルダのメールが消えてしまいました。
受信トレイ、送信済みトレイ、下書き、ごみ箱の他、自分で作成していた振り分け先のフォルダなどもすべて、クリックすると「メッセージが見つかりませんでした」と表示されます。
ただ、メッセージリストの上部には、そのフォルダに入っていたメッセージの件数は表示されています。
それから、メールを送信しても送信済みトレイに残りません。まったく消えてしまってどこにもないです。

自分で調べてみて、C:\Users\ｘｘｘ\AppData\Roaming\Thunderbird\Profiles\ｘｘｘ\Mail\Local Foldersにあったmsfファイルを削除してみましたが、一部のメールしか復旧しませんでした。
フォルダの修復も同様でした。
msfファイルのあったフォルダに、各トレイの名前と同じ拡張子のないファイルがあって、その中には、消えてしまったメールの情報が残っているのかと思います（メモ帳で開いて見てみました）

メールを復旧する手立ては、他に何かないでしょうか。
仕事でやりとりしていたメールがすべて消えてしまい、途方に暮れています。
どなたかお知恵を貸してください。よろしくお願いいたします。