msfファイルというものを削除するのが不安でしたが
どこみても、同じ対応のようでしたので
プロファイルコピーしたあと、inbox.msfファイル削除してみたいと思います。
大変失礼しました。

「サーバーに保存する」を解除したらメールが入るようになりました。
https://oshiete.goo.ne.jp/qa/6029004.html

最適化はメール削除されない
https://support.mozilla.org/ja/kb/compacting-folders

プロファイルコピーしたあと、
inbox.msfまたはINBOX.msfファイルがあるので、フォルダを開いた状態で、Thunderbirdを終了してから、削除して再起動してみてください。
viewtopic.php?f=3&t=16236
https://okwave.jp/qa/q8673976.html

win10、デスクトップPCにつきまして
gmailを32bit版thunderbirdで利用してきました。
今までpopを利用していたのですが、

・32bit版thunderbirdから、popアカウント削除
・32bit版thunderbirdアンインストール
・64bit版thunderbirdインストール
・imapアカウント追加

を行ったところ、popの時にローカルファルダに格納したメールも
件数が表示されるようになり、問題ないように思われました。

しかし、メールをフォルダし利用しているのですが
一部ファイルにて開こうとすると
（ショッピング（148）と、メール数の表示はあります）
＊〇〇@〇〇.jpのショッピングフォルダーの要約ファイルを開けませんでした。
　ディスクエラーが発生したか、ファイルのフルパスが長すぎます。

とエラーが出て開くことができません。
開けるフォルダもあるのですが、どうしたら良いでしょうか。
大変申し訳ございませんが、どうぞ宜しくお願い致します。