具体的に教えていただきありがとうございました。

　そのように設定しましたなら、登録ができました。

　
[color=#006600]＊質問・投稿する前に [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum][b][u][color=#0000FF]フォーラムの利用について[/color][/u][/b][/url] をしっかり読んで、その内容を理解
　した上で、それに沿って投稿しましょう。
＊ご自分の利用環境として、正確な OS の名称・種類と Thunderbird のバージョンぐ
　らいは書き添えましょう。[/color]
　
[color=#FF0000][b]上記は飾りではありません。
しっかり読んで、ちゃんと書き添えましょう。[/b][/color]

　
[b][受信サーバ][/b]
メニューからアカウント設定を開き、該当アカウントの [サーバ設定] > [ユーザ名] の
箇所を [color=#0000ff]シークレットID[/color] に書き換えます。
そして、[OK] をクリックして閉じて、Thunderbird を再起動します。

参照スクリーンショット
[attachment=1]サーバ設定.png[/attachment]

[b][送信サーバ][/b]
メニューからアカウント設定を開き、左側アカウント別ツリーペインの最下段にある
[送信（SMTP）サーバ] をクリックし、該当のアカウントを選択して [編集] でユーザ名
を [color=#0000ff]シークレットID[/color] に書き換えます。
そして、[OK] をクリックして閉じて、Thunderbird を再起動します。

参照スクリーンショット
[attachment=0]送信 (SMTP) サーバ.png[/attachment]

[補足]
アカウント名は必要ならば任意の名称に編集可能です。
全角日本語よりも半角英字のみにしておくほうが無難です。
また、相手に表示される名前（ディスプレイネーム）も必要ならば書き換え可能です。

すみません。具体的に教えてください。

　アカント名はそのまま
　相手に表示される名前はそのまま

　ユーザー名だけシークレットＩＤにですか。

　
[color=#006600]＊質問・投稿する前に、製品のヘルプ、このフォーラム内を検索・閲覧して該当項目や
　同類・類似事例がないか、確認してみましょう。
　また、広くインターネット上でも同類・類似事例がないか、調べてみましょう。
＊質問・投稿する前に [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum][b][u][color=#0000FF]フォーラムの利用について[/color][/u][/b][/url] をしっかり読んで、その内容を理解
　した上で、それに沿って投稿しましょう。
＊ご自分の利用環境として、正確な OS の名称・種類と Thunderbird のバージョンぐ
　らいは書き添えましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後は放置せずに、結果や経緯を必ず書くようにし
　ましょう。
＊ここは相互ユーザサポートを通じて、各種情報・事例をユーザ同士でシェアする場で
　もあります。[/color]
　
　
Yahoo! JAPAN のメールアカウントで「シークレットID」を設定したならば、Thunderbird も
同様に Yahoo! JAPAN アカウントのユーザ名を「シークレットID」と同じものに変更すればい
いだけです。

Thunderbird のアカウント設定にある送受信サーバともユーザ名を「シークレットID」に変更
してみてください。
　注：変更後は Thunderbird を再起動させて変更を反映させてください。

[参照] 下記のガイドやヘルプにも同様の注意点の説明があります。
[url=http://id.yahoo.co.jp/security/secret_id.html]シークレットID - Yahoo! JAPAN IDガイド[/url]
[url=http://www.yahoo-help.jp/app/answers/detail/a_id/41951/p/544]Yahoo! JAPAN IDに関するヘルプ - シークレットIDとは[/url]


【大きなお世話】
yahoo じゃなくて Yahoo! JAPAN です。
thunderbird じゃなくて Thunderbird です。
誤解がないように伝えるためにも正確に書くように心がけましょう。

　yahooでシークレットＩＤを作成しました。
　新たに購入したパソコンでthunderbirdでアカントの設定に苦労しています。

　なんとかアカントを登録しましたが、送受信ができません。
　thunderbirdではマスターパスワードを設定しています。

　どなたか同様な事例で設定して使用している方がいらしたら、アドバイスをお願いいたします。

　現在の状況は送受信しようとすると、パスワードの入力を求められていて、正しいパスワードの
　入力だと思うのですが、違うと表示されています。