[color=#006600]＊質問・投稿する前に [url=http://forums.mozillazine.jp/faq.php?mode=forum]フォーラムの利用について[/url] を読んでその内容を理解した上で
　それに沿って投稿しましょう。
＊ご自分の利用環境として OS の種類と Thunderbird の正確なバージョンぐらいは書
　き添えましょう。
＊質問した後やアドバイスをもらった後には結果や経緯を必ず書くようにしましょう。[/color]
　
　
[quote="ふたご座"]バックアップとして、保存先フォルダを残しておきました。[/quote]
保存先フォルダではわかりません。
具体的にバックアップとして、どこのどういうフォルダを保存していたのですか？

[quote="ふたご座"]Thunderbird 10.0.2を新規にインストールしました。
アカウントを作成（アカウントパスワードは保存していません）し、バックアップで保存したものをリストアし、保存先設定場所に指定しました。
※今までこの方法でよかったです。[/quote]
バックアップしていたものを具体的にどのように復元（リストア）されたのですか？

[quote="ふたご座"]アンインストールも行いました。（関係するフォルダも手動で削除）[/quote]
バックアップ保存していたデータを復元するのにアンインストールは関係ありません。
「関係するフォルダも手動で削除」とは、どこの何というフォルダですか？


以前、Thunderbird を利用していた環境で正しくユーザデータをバックアップ保存していて
新しい環境で正しく復元（リストア）したならば、問題は起こりません。
ですので、バックアップや復元（リストア）のどこかの作業手順に問題があると思われます。

その具体的におこなった作業手順を書いていただかないと、具体的にはアドバイスもおこな
えません。
　[color=green]＃バックアップ時の OS の種類や Thunderbird のバージョンも書き添えましょう。[/color]

まずは、
・何をバックアップしていて、何を復元（リストア）されたいのか
・バックアップでは、どこの何をバックアップしたのか
・復元（リストア）では、何をどこにどうされたのか　
を書いてください。　
　

OSをWin7Proを新規でインストールしました。
バックアップとして、保存先フォルダを残しておきました。
Thunderbird 10.0.2を新規にインストールしました。
アカウントを作成（アカウントパスワードは保存していません）し、バックアップで保存したものをリストアし、保存先設定場所に指定しました。
※今までこの方法でよかったです。

今回はこれでうまくいきませんでした。

１、復旧したメールはこの１年のみ（2012年）それより過去のものは消えてしまいました。
２、振り分けてあったものはツリー構造だけが残り、中身は消えてしまいました。
３、送信済みメールは消えてしまいました。

新規受信はできている様です。
Ver、3.1.19でも試しましたが同じ症状でした。
アンインストールも行いました。（関係するフォルダも手動で削除）
メールデータはバックアップのまま残してあるのでいいのですが・・・。なんともならい状態です。

最初の起動のみ（アカウントパスワードを入れてない状態）では大丈夫そうなのですが、そのまま再起動しますと上記の様な状態になってしまいます。

重複している点もあるかもしれませんが、宜しくお願いいたします。